Protein–RNA interactions for Protein: P01783

Ig heavy chain V region MOPC 21 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01783 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01783 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
P01783 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01783 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01783 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01783 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01783 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01783 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01783 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01783 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01783 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01783 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01783 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01783 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01783 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01783 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01783 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01783 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01783 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01783 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01783 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01783 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01783 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01783 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01783 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01783 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01783 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01783 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01783 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01783 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01783 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01783 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01783 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16■□□□□ 0.15
P01783 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
P01783 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
P01783 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01783 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01783 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01783 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01783 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01783 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01783 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
P01783 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
P01783 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01783 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01783 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01783 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01783 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01783 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01783 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
P01783 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01783 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01783 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01783 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01783 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01783 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
P01783 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01783 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01783 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01783 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01783 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
P01783 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01783 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01783 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01783 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01783 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01783 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01783 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01783 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01783 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01783 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01783 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01783 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01783 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01783 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01783 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01783 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01783 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01783 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01783 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01783 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01783 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01783 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01783 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01783 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01783 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01783 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01783 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01783 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01783 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01783 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01783 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01783 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01783 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01783 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01783 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
P01783 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01783 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01783 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
P01783 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms