Protein–RNA interactions for Protein: P01727

Ig lambda-1 chain V region S43, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01727 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01727 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01727 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01727 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01727 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01727 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01727 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01727 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
P01727 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
P01727 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01727 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01727 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
P01727 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
P01727 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
P01727 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01727 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01727 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01727 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01727 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01727 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01727 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01727 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01727 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01727 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01727 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01727 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
P01727 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01727 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
P01727 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01727 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01727 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01727 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01727 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01727 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01727 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01727 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01727 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01727 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01727 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01727 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01727 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01727 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
P01727 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01727 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01727 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01727 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01727 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01727 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01727 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01727 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01727 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01727 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01727 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01727 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01727 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01727 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01727 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01727 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01727 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01727 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01727 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
P01727 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01727 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01727 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01727 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01727 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01727 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01727 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01727 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01727 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01727 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01727 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01727 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01727 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01727 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
P01727 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01727 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01727 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01727 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01727 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01727 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01727 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
P01727 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01727 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01727 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01727 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01727 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01727 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01727 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01727 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01727 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01727 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01727 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01727 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01727 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
P01727 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01727 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
P01727 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01727 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01727 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms