Protein–RNA interactions for Protein: P01643

Ig kappa chain V-V region MOPC 173, mousemouse

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Length 108 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01643 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01643 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01643 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01643 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01643 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01643 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01643 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01643 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01643 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01643 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01643 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01643 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01643 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01643 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01643 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01643 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01643 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
P01643 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
P01643 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01643 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01643 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01643 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01643 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01643 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01643 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01643 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01643 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01643 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01643 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01643 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
P01643 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01643 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01643 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
P01643 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
P01643 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
P01643 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
P01643 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
P01643 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01643 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01643 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01643 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01643 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01643 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01643 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
P01643 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01643 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01643 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01643 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01643 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01643 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01643 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01643 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01643 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01643 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01643 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01643 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01643 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01643 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01643 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01643 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01643 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01643 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01643 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01643 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01643 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01643 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01643 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01643 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01643 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01643 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01643 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01643 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
P01643 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01643 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01643 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
P01643 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01643 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01643 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01643 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01643 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01643 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01643 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01643 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01643 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01643 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
P01643 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01643 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01643 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01643 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
P01643 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01643 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01643 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01643 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01643 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01643 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01643 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01643 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01643 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01643 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
P01643 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
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