Protein–RNA interactions for Protein: O89026

Robo1, Roundabout homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Robo1O89026 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Robo1O89026 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Robo1O89026 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Robo1O89026 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Robo1O89026 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Robo1O89026 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Robo1O89026 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Robo1O89026 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Robo1O89026 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Robo1O89026 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Robo1O89026 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Robo1O89026 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Robo1O89026 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Robo1O89026 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Robo1O89026 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Robo1O89026 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Robo1O89026 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Robo1O89026 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Robo1O89026 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Robo1O89026 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Robo1O89026 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Robo1O89026 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Robo1O89026 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Robo1O89026 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Robo1O89026 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Robo1O89026 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Robo1O89026 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Robo1O89026 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Robo1O89026 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Robo1O89026 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Robo1O89026 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Robo1O89026 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Robo1O89026 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Robo1O89026 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Robo1O89026 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Robo1O89026 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Robo1O89026 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Robo1O89026 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Robo1O89026 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Robo1O89026 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Robo1O89026 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Robo1O89026 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Robo1O89026 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Robo1O89026 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Robo1O89026 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Robo1O89026 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Robo1O89026 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Robo1O89026 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Robo1O89026 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Robo1O89026 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Robo1O89026 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Robo1O89026 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Robo1O89026 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Robo1O89026 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Robo1O89026 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Robo1O89026 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Robo1O89026 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Robo1O89026 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Robo1O89026 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Robo1O89026 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Robo1O89026 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Robo1O89026 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Robo1O89026 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Robo1O89026 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Robo1O89026 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Robo1O89026 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Robo1O89026 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Robo1O89026 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Robo1O89026 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Robo1O89026 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Robo1O89026 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Robo1O89026 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Robo1O89026 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Robo1O89026 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Robo1O89026 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Robo1O89026 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Robo1O89026 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Robo1O89026 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Robo1O89026 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Robo1O89026 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Robo1O89026 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Robo1O89026 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Robo1O89026 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Robo1O89026 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Robo1O89026 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Robo1O89026 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Robo1O89026 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
Robo1O89026 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Robo1O89026 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Robo1O89026 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Robo1O89026 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Robo1O89026 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Robo1O89026 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Robo1O89026 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Robo1O89026 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Robo1O89026 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Robo1O89026 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Robo1O89026 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Robo1O89026 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Robo1O89026 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms