Protein–RNA interactions for Protein: O89001

Cpd, Carboxypeptidase D, mousemouse

Predictions only

Length 1,377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CpdO89001 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CpdO89001 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CpdO89001 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CpdO89001 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CpdO89001 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CpdO89001 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CpdO89001 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CpdO89001 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CpdO89001 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CpdO89001 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CpdO89001 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CpdO89001 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CpdO89001 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CpdO89001 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CpdO89001 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CpdO89001 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CpdO89001 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CpdO89001 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CpdO89001 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CpdO89001 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CpdO89001 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CpdO89001 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CpdO89001 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CpdO89001 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CpdO89001 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CpdO89001 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CpdO89001 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CpdO89001 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CpdO89001 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CpdO89001 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CpdO89001 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CpdO89001 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CpdO89001 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CpdO89001 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CpdO89001 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CpdO89001 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CpdO89001 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CpdO89001 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CpdO89001 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CpdO89001 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CpdO89001 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CpdO89001 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CpdO89001 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CpdO89001 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CpdO89001 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CpdO89001 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CpdO89001 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CpdO89001 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CpdO89001 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CpdO89001 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CpdO89001 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CpdO89001 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CpdO89001 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CpdO89001 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CpdO89001 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CpdO89001 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CpdO89001 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CpdO89001 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CpdO89001 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CpdO89001 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CpdO89001 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CpdO89001 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CpdO89001 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CpdO89001 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CpdO89001 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CpdO89001 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CpdO89001 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CpdO89001 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CpdO89001 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CpdO89001 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CpdO89001 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CpdO89001 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CpdO89001 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CpdO89001 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CpdO89001 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CpdO89001 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CpdO89001 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CpdO89001 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CpdO89001 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CpdO89001 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CpdO89001 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CpdO89001 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CpdO89001 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CpdO89001 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CpdO89001 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CpdO89001 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CpdO89001 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CpdO89001 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CpdO89001 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CpdO89001 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CpdO89001 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CpdO89001 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CpdO89001 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CpdO89001 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CpdO89001 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CpdO89001 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CpdO89001 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CpdO89001 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CpdO89001 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CpdO89001 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms