Protein–RNA interactions for Protein: O88974

Setdb1, Histone-lysine N-methyltransferase SETDB1, mousemouse

Predictions only

Length 1,307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setdb1O88974 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Setdb1O88974 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Setdb1O88974 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Setdb1O88974 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Setdb1O88974 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Setdb1O88974 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Setdb1O88974 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Setdb1O88974 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Setdb1O88974 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Setdb1O88974 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Setdb1O88974 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Setdb1O88974 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Setdb1O88974 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Setdb1O88974 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Setdb1O88974 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Setdb1O88974 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Setdb1O88974 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Setdb1O88974 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Setdb1O88974 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Setdb1O88974 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Setdb1O88974 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Setdb1O88974 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Setdb1O88974 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Setdb1O88974 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Setdb1O88974 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Setdb1O88974 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Setdb1O88974 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Setdb1O88974 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Setdb1O88974 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Setdb1O88974 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Setdb1O88974 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Setdb1O88974 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Setdb1O88974 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Setdb1O88974 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Setdb1O88974 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Setdb1O88974 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Setdb1O88974 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Setdb1O88974 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Setdb1O88974 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Setdb1O88974 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Setdb1O88974 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Setdb1O88974 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Setdb1O88974 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Setdb1O88974 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Setdb1O88974 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Setdb1O88974 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Setdb1O88974 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Setdb1O88974 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Setdb1O88974 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Setdb1O88974 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Setdb1O88974 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Setdb1O88974 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Setdb1O88974 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Setdb1O88974 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Setdb1O88974 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Setdb1O88974 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Setdb1O88974 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Setdb1O88974 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Setdb1O88974 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Setdb1O88974 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Setdb1O88974 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Setdb1O88974 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Setdb1O88974 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Setdb1O88974 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Setdb1O88974 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Setdb1O88974 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Setdb1O88974 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Setdb1O88974 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Setdb1O88974 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Setdb1O88974 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Setdb1O88974 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Setdb1O88974 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Setdb1O88974 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Setdb1O88974 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Setdb1O88974 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Setdb1O88974 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Setdb1O88974 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Setdb1O88974 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Setdb1O88974 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Setdb1O88974 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Setdb1O88974 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Setdb1O88974 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Setdb1O88974 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Setdb1O88974 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Setdb1O88974 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Setdb1O88974 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Setdb1O88974 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Setdb1O88974 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Setdb1O88974 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Setdb1O88974 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Setdb1O88974 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Setdb1O88974 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Setdb1O88974 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Setdb1O88974 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Setdb1O88974 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Setdb1O88974 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Setdb1O88974 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Setdb1O88974 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Setdb1O88974 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Setdb1O88974 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.6 ms