Protein–RNA interactions for Protein: O88968

Tcn2, Transcobalamin-2, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcn2O88968 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tcn2O88968 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tcn2O88968 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tcn2O88968 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tcn2O88968 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tcn2O88968 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tcn2O88968 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tcn2O88968 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tcn2O88968 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tcn2O88968 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tcn2O88968 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tcn2O88968 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tcn2O88968 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tcn2O88968 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tcn2O88968 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tcn2O88968 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tcn2O88968 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tcn2O88968 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tcn2O88968 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tcn2O88968 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tcn2O88968 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tcn2O88968 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tcn2O88968 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tcn2O88968 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tcn2O88968 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tcn2O88968 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tcn2O88968 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tcn2O88968 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tcn2O88968 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tcn2O88968 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tcn2O88968 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tcn2O88968 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tcn2O88968 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tcn2O88968 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tcn2O88968 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tcn2O88968 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tcn2O88968 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tcn2O88968 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tcn2O88968 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tcn2O88968 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tcn2O88968 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tcn2O88968 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tcn2O88968 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tcn2O88968 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tcn2O88968 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Tcn2O88968 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tcn2O88968 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tcn2O88968 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tcn2O88968 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tcn2O88968 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tcn2O88968 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tcn2O88968 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tcn2O88968 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tcn2O88968 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tcn2O88968 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tcn2O88968 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tcn2O88968 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tcn2O88968 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tcn2O88968 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tcn2O88968 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tcn2O88968 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tcn2O88968 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tcn2O88968 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tcn2O88968 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tcn2O88968 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tcn2O88968 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tcn2O88968 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Tcn2O88968 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tcn2O88968 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tcn2O88968 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tcn2O88968 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Tcn2O88968 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tcn2O88968 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tcn2O88968 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tcn2O88968 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tcn2O88968 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tcn2O88968 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tcn2O88968 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tcn2O88968 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tcn2O88968 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tcn2O88968 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tcn2O88968 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Tcn2O88968 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tcn2O88968 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tcn2O88968 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tcn2O88968 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tcn2O88968 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tcn2O88968 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tcn2O88968 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tcn2O88968 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tcn2O88968 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tcn2O88968 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tcn2O88968 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tcn2O88968 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tcn2O88968 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tcn2O88968 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tcn2O88968 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tcn2O88968 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tcn2O88968 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tcn2O88968 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms