Protein–RNA interactions for Protein: O88834

Shd, SH2 domain-containing adapter protein D, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ShdO88834 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ShdO88834 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ShdO88834 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ShdO88834 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ShdO88834 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ShdO88834 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ShdO88834 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ShdO88834 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ShdO88834 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ShdO88834 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ShdO88834 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ShdO88834 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ShdO88834 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ShdO88834 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ShdO88834 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ShdO88834 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ShdO88834 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ShdO88834 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ShdO88834 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ShdO88834 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ShdO88834 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ShdO88834 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ShdO88834 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ShdO88834 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ShdO88834 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ShdO88834 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ShdO88834 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ShdO88834 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ShdO88834 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ShdO88834 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ShdO88834 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ShdO88834 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ShdO88834 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ShdO88834 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ShdO88834 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ShdO88834 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ShdO88834 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ShdO88834 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ShdO88834 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ShdO88834 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ShdO88834 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ShdO88834 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ShdO88834 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ShdO88834 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ShdO88834 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ShdO88834 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ShdO88834 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ShdO88834 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ShdO88834 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ShdO88834 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ShdO88834 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ShdO88834 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ShdO88834 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ShdO88834 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ShdO88834 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ShdO88834 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ShdO88834 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ShdO88834 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ShdO88834 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ShdO88834 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ShdO88834 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ShdO88834 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ShdO88834 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ShdO88834 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ShdO88834 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ShdO88834 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ShdO88834 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ShdO88834 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ShdO88834 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ShdO88834 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ShdO88834 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ShdO88834 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ShdO88834 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ShdO88834 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ShdO88834 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ShdO88834 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ShdO88834 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ShdO88834 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ShdO88834 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ShdO88834 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ShdO88834 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ShdO88834 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ShdO88834 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ShdO88834 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ShdO88834 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ShdO88834 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ShdO88834 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ShdO88834 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ShdO88834 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ShdO88834 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ShdO88834 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ShdO88834 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ShdO88834 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ShdO88834 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ShdO88834 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ShdO88834 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ShdO88834 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ShdO88834 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ShdO88834 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ShdO88834 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms