Protein–RNA interactions for Protein: O88792

F11r, Junctional adhesion molecule A, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F11rO88792 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
F11rO88792 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
F11rO88792 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
F11rO88792 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
F11rO88792 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
F11rO88792 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
F11rO88792 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
F11rO88792 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
F11rO88792 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
F11rO88792 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
F11rO88792 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
F11rO88792 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
F11rO88792 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
F11rO88792 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
F11rO88792 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
F11rO88792 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
F11rO88792 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
F11rO88792 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
F11rO88792 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
F11rO88792 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
F11rO88792 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
F11rO88792 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
F11rO88792 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
F11rO88792 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
F11rO88792 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
F11rO88792 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
F11rO88792 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
F11rO88792 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
F11rO88792 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
F11rO88792 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
F11rO88792 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
F11rO88792 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
F11rO88792 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
F11rO88792 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
F11rO88792 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
F11rO88792 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
F11rO88792 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
F11rO88792 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
F11rO88792 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
F11rO88792 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
F11rO88792 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
F11rO88792 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
F11rO88792 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
F11rO88792 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
F11rO88792 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
F11rO88792 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
F11rO88792 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
F11rO88792 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
F11rO88792 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
F11rO88792 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
F11rO88792 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
F11rO88792 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
F11rO88792 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
F11rO88792 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
F11rO88792 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
F11rO88792 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
F11rO88792 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
F11rO88792 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
F11rO88792 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
F11rO88792 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
F11rO88792 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
F11rO88792 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
F11rO88792 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
F11rO88792 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
F11rO88792 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
F11rO88792 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
F11rO88792 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
F11rO88792 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
F11rO88792 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
F11rO88792 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
F11rO88792 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
F11rO88792 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
F11rO88792 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
F11rO88792 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
F11rO88792 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
F11rO88792 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
F11rO88792 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
F11rO88792 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
F11rO88792 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
F11rO88792 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
F11rO88792 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
F11rO88792 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
F11rO88792 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
F11rO88792 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
F11rO88792 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
F11rO88792 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
F11rO88792 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
F11rO88792 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
F11rO88792 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
F11rO88792 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
F11rO88792 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
F11rO88792 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
F11rO88792 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
F11rO88792 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
F11rO88792 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
F11rO88792 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
F11rO88792 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
F11rO88792 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
F11rO88792 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
F11rO88792 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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