Protein–RNA interactions for Protein: O88561

Slc27a3, Long-chain fatty acid transport protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a3O88561 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc27a3O88561 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc27a3O88561 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc27a3O88561 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc27a3O88561 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc27a3O88561 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc27a3O88561 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc27a3O88561 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc27a3O88561 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc27a3O88561 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc27a3O88561 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc27a3O88561 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc27a3O88561 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc27a3O88561 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc27a3O88561 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc27a3O88561 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc27a3O88561 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc27a3O88561 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Slc27a3O88561 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Slc27a3O88561 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Slc27a3O88561 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Slc27a3O88561 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Slc27a3O88561 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Slc27a3O88561 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Slc27a3O88561 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc27a3O88561 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc27a3O88561 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc27a3O88561 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc27a3O88561 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc27a3O88561 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc27a3O88561 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc27a3O88561 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc27a3O88561 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc27a3O88561 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc27a3O88561 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc27a3O88561 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc27a3O88561 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc27a3O88561 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc27a3O88561 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc27a3O88561 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc27a3O88561 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc27a3O88561 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc27a3O88561 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc27a3O88561 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc27a3O88561 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc27a3O88561 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc27a3O88561 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc27a3O88561 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc27a3O88561 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc27a3O88561 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc27a3O88561 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc27a3O88561 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc27a3O88561 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc27a3O88561 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc27a3O88561 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc27a3O88561 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc27a3O88561 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc27a3O88561 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc27a3O88561 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc27a3O88561 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc27a3O88561 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc27a3O88561 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc27a3O88561 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc27a3O88561 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc27a3O88561 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc27a3O88561 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc27a3O88561 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc27a3O88561 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc27a3O88561 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc27a3O88561 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc27a3O88561 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc27a3O88561 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc27a3O88561 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc27a3O88561 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc27a3O88561 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc27a3O88561 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc27a3O88561 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc27a3O88561 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc27a3O88561 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc27a3O88561 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc27a3O88561 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc27a3O88561 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc27a3O88561 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc27a3O88561 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc27a3O88561 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc27a3O88561 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc27a3O88561 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc27a3O88561 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc27a3O88561 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc27a3O88561 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc27a3O88561 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc27a3O88561 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc27a3O88561 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc27a3O88561 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc27a3O88561 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc27a3O88561 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc27a3O88561 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc27a3O88561 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc27a3O88561 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc27a3O88561 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms