Protein–RNA interactions for Protein: O88552

Cldn2, Claudin-2, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn2O88552 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cldn2O88552 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Cldn2O88552 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cldn2O88552 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cldn2O88552 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cldn2O88552 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cldn2O88552 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cldn2O88552 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cldn2O88552 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cldn2O88552 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cldn2O88552 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cldn2O88552 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cldn2O88552 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Cldn2O88552 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cldn2O88552 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cldn2O88552 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cldn2O88552 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cldn2O88552 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cldn2O88552 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cldn2O88552 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cldn2O88552 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cldn2O88552 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cldn2O88552 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cldn2O88552 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cldn2O88552 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cldn2O88552 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cldn2O88552 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cldn2O88552 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cldn2O88552 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Cldn2O88552 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Cldn2O88552 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cldn2O88552 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cldn2O88552 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cldn2O88552 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cldn2O88552 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cldn2O88552 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cldn2O88552 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cldn2O88552 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cldn2O88552 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cldn2O88552 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Cldn2O88552 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cldn2O88552 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cldn2O88552 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cldn2O88552 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cldn2O88552 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cldn2O88552 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cldn2O88552 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
Cldn2O88552 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cldn2O88552 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cldn2O88552 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cldn2O88552 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cldn2O88552 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cldn2O88552 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cldn2O88552 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cldn2O88552 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cldn2O88552 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cldn2O88552 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cldn2O88552 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cldn2O88552 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Cldn2O88552 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cldn2O88552 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cldn2O88552 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cldn2O88552 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cldn2O88552 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cldn2O88552 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cldn2O88552 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cldn2O88552 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cldn2O88552 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cldn2O88552 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cldn2O88552 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cldn2O88552 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cldn2O88552 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Cldn2O88552 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cldn2O88552 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cldn2O88552 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cldn2O88552 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cldn2O88552 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cldn2O88552 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cldn2O88552 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cldn2O88552 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cldn2O88552 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cldn2O88552 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cldn2O88552 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cldn2O88552 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cldn2O88552 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cldn2O88552 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cldn2O88552 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cldn2O88552 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cldn2O88552 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cldn2O88552 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Cldn2O88552 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cldn2O88552 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cldn2O88552 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cldn2O88552 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cldn2O88552 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cldn2O88552 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cldn2O88552 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cldn2O88552 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cldn2O88552 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cldn2O88552 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.3 ms