Protein–RNA interactions for Protein: O88545

Cops6, COP9 signalosome complex subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops6O88545 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cops6O88545 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cops6O88545 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Cops6O88545 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Cops6O88545 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cops6O88545 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Cops6O88545 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cops6O88545 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cops6O88545 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cops6O88545 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cops6O88545 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cops6O88545 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cops6O88545 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cops6O88545 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cops6O88545 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cops6O88545 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cops6O88545 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cops6O88545 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cops6O88545 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cops6O88545 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cops6O88545 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cops6O88545 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cops6O88545 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cops6O88545 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cops6O88545 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Cops6O88545 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cops6O88545 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cops6O88545 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cops6O88545 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cops6O88545 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cops6O88545 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cops6O88545 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cops6O88545 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cops6O88545 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cops6O88545 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cops6O88545 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cops6O88545 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cops6O88545 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Cops6O88545 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Cops6O88545 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cops6O88545 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cops6O88545 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cops6O88545 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cops6O88545 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cops6O88545 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cops6O88545 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cops6O88545 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cops6O88545 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cops6O88545 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cops6O88545 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cops6O88545 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cops6O88545 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Cops6O88545 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cops6O88545 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cops6O88545 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cops6O88545 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cops6O88545 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cops6O88545 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cops6O88545 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Cops6O88545 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cops6O88545 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cops6O88545 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cops6O88545 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cops6O88545 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cops6O88545 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cops6O88545 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cops6O88545 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cops6O88545 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cops6O88545 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cops6O88545 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cops6O88545 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cops6O88545 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cops6O88545 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cops6O88545 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cops6O88545 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cops6O88545 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cops6O88545 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cops6O88545 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cops6O88545 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cops6O88545 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cops6O88545 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cops6O88545 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cops6O88545 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Cops6O88545 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cops6O88545 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cops6O88545 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cops6O88545 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cops6O88545 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cops6O88545 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cops6O88545 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cops6O88545 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Cops6O88545 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cops6O88545 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Cops6O88545 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cops6O88545 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cops6O88545 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cops6O88545 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cops6O88545 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Cops6O88545 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cops6O88545 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms