Protein–RNA interactions for Protein: O88509

Dnmt3b, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3bO88509 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dnmt3bO88509 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dnmt3bO88509 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dnmt3bO88509 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Dnmt3bO88509 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dnmt3bO88509 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dnmt3bO88509 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dnmt3bO88509 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dnmt3bO88509 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Dnmt3bO88509 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dnmt3bO88509 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dnmt3bO88509 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dnmt3bO88509 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dnmt3bO88509 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dnmt3bO88509 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dnmt3bO88509 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dnmt3bO88509 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dnmt3bO88509 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dnmt3bO88509 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dnmt3bO88509 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dnmt3bO88509 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dnmt3bO88509 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dnmt3bO88509 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dnmt3bO88509 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dnmt3bO88509 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dnmt3bO88509 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Dnmt3bO88509 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Dnmt3bO88509 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dnmt3bO88509 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dnmt3bO88509 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dnmt3bO88509 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Dnmt3bO88509 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnmt3bO88509 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnmt3bO88509 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnmt3bO88509 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnmt3bO88509 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnmt3bO88509 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnmt3bO88509 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnmt3bO88509 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnmt3bO88509 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnmt3bO88509 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnmt3bO88509 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnmt3bO88509 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnmt3bO88509 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnmt3bO88509 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnmt3bO88509 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnmt3bO88509 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnmt3bO88509 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnmt3bO88509 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnmt3bO88509 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnmt3bO88509 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnmt3bO88509 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnmt3bO88509 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnmt3bO88509 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnmt3bO88509 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnmt3bO88509 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnmt3bO88509 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnmt3bO88509 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnmt3bO88509 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnmt3bO88509 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnmt3bO88509 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnmt3bO88509 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnmt3bO88509 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnmt3bO88509 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnmt3bO88509 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnmt3bO88509 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnmt3bO88509 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnmt3bO88509 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnmt3bO88509 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnmt3bO88509 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnmt3bO88509 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnmt3bO88509 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnmt3bO88509 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnmt3bO88509 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnmt3bO88509 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnmt3bO88509 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnmt3bO88509 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnmt3bO88509 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnmt3bO88509 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnmt3bO88509 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnmt3bO88509 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnmt3bO88509 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnmt3bO88509 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnmt3bO88509 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnmt3bO88509 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnmt3bO88509 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnmt3bO88509 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnmt3bO88509 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnmt3bO88509 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnmt3bO88509 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnmt3bO88509 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnmt3bO88509 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnmt3bO88509 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnmt3bO88509 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnmt3bO88509 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnmt3bO88509 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Dnmt3bO88509 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dnmt3bO88509 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dnmt3bO88509 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dnmt3bO88509 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms