Protein–RNA interactions for Protein: O88282

Bcl6b, B-cell CLL/lymphoma 6 member B protein, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcl6bO88282 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bcl6bO88282 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bcl6bO88282 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bcl6bO88282 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bcl6bO88282 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bcl6bO88282 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bcl6bO88282 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bcl6bO88282 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bcl6bO88282 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bcl6bO88282 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bcl6bO88282 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bcl6bO88282 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bcl6bO88282 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bcl6bO88282 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bcl6bO88282 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bcl6bO88282 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bcl6bO88282 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bcl6bO88282 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bcl6bO88282 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bcl6bO88282 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bcl6bO88282 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bcl6bO88282 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bcl6bO88282 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bcl6bO88282 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bcl6bO88282 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bcl6bO88282 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bcl6bO88282 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bcl6bO88282 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bcl6bO88282 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bcl6bO88282 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bcl6bO88282 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Bcl6bO88282 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bcl6bO88282 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bcl6bO88282 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bcl6bO88282 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Bcl6bO88282 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Bcl6bO88282 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Bcl6bO88282 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bcl6bO88282 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bcl6bO88282 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bcl6bO88282 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Bcl6bO88282 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bcl6bO88282 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bcl6bO88282 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bcl6bO88282 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bcl6bO88282 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bcl6bO88282 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bcl6bO88282 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bcl6bO88282 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Bcl6bO88282 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Bcl6bO88282 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bcl6bO88282 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bcl6bO88282 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bcl6bO88282 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Bcl6bO88282 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Bcl6bO88282 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bcl6bO88282 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bcl6bO88282 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Bcl6bO88282 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bcl6bO88282 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bcl6bO88282 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Bcl6bO88282 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Bcl6bO88282 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Bcl6bO88282 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bcl6bO88282 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Bcl6bO88282 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bcl6bO88282 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bcl6bO88282 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bcl6bO88282 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bcl6bO88282 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bcl6bO88282 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bcl6bO88282 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bcl6bO88282 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bcl6bO88282 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bcl6bO88282 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bcl6bO88282 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bcl6bO88282 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bcl6bO88282 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bcl6bO88282 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bcl6bO88282 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bcl6bO88282 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bcl6bO88282 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bcl6bO88282 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bcl6bO88282 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bcl6bO88282 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bcl6bO88282 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bcl6bO88282 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bcl6bO88282 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bcl6bO88282 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bcl6bO88282 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bcl6bO88282 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bcl6bO88282 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Bcl6bO88282 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bcl6bO88282 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bcl6bO88282 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bcl6bO88282 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bcl6bO88282 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bcl6bO88282 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bcl6bO88282 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bcl6bO88282 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms