Protein–RNA interactions for Protein: O55230

Rad51d, DNA repair protein RAD51 homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad51dO55230 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rad51dO55230 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rad51dO55230 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rad51dO55230 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rad51dO55230 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rad51dO55230 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rad51dO55230 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Rad51dO55230 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rad51dO55230 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Rad51dO55230 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rad51dO55230 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rad51dO55230 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rad51dO55230 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rad51dO55230 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rad51dO55230 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rad51dO55230 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rad51dO55230 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rad51dO55230 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rad51dO55230 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rad51dO55230 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rad51dO55230 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rad51dO55230 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rad51dO55230 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Rad51dO55230 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rad51dO55230 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rad51dO55230 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rad51dO55230 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Rad51dO55230 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rad51dO55230 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rad51dO55230 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rad51dO55230 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rad51dO55230 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rad51dO55230 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rad51dO55230 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rad51dO55230 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rad51dO55230 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rad51dO55230 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rad51dO55230 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rad51dO55230 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rad51dO55230 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rad51dO55230 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rad51dO55230 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rad51dO55230 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rad51dO55230 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rad51dO55230 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rad51dO55230 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rad51dO55230 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rad51dO55230 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rad51dO55230 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rad51dO55230 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rad51dO55230 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rad51dO55230 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rad51dO55230 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rad51dO55230 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rad51dO55230 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Rad51dO55230 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rad51dO55230 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rad51dO55230 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rad51dO55230 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rad51dO55230 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rad51dO55230 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rad51dO55230 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rad51dO55230 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rad51dO55230 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rad51dO55230 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rad51dO55230 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rad51dO55230 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rad51dO55230 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rad51dO55230 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rad51dO55230 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rad51dO55230 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rad51dO55230 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rad51dO55230 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rad51dO55230 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rad51dO55230 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rad51dO55230 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rad51dO55230 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rad51dO55230 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rad51dO55230 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rad51dO55230 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rad51dO55230 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rad51dO55230 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rad51dO55230 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rad51dO55230 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rad51dO55230 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rad51dO55230 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rad51dO55230 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rad51dO55230 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rad51dO55230 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rad51dO55230 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rad51dO55230 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rad51dO55230 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rad51dO55230 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rad51dO55230 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rad51dO55230 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rad51dO55230 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rad51dO55230 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Rad51dO55230 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rad51dO55230 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rad51dO55230 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms