Protein–RNA interactions for Protein: O55187

Cbx4, E3 SUMO-protein ligase CBX4, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx4O55187 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cbx4O55187 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cbx4O55187 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cbx4O55187 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cbx4O55187 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cbx4O55187 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cbx4O55187 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cbx4O55187 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cbx4O55187 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cbx4O55187 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cbx4O55187 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cbx4O55187 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Cbx4O55187 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Cbx4O55187 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cbx4O55187 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cbx4O55187 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cbx4O55187 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cbx4O55187 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cbx4O55187 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cbx4O55187 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cbx4O55187 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cbx4O55187 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cbx4O55187 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cbx4O55187 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cbx4O55187 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cbx4O55187 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cbx4O55187 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Cbx4O55187 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cbx4O55187 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cbx4O55187 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cbx4O55187 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cbx4O55187 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cbx4O55187 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cbx4O55187 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cbx4O55187 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cbx4O55187 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cbx4O55187 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cbx4O55187 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Cbx4O55187 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cbx4O55187 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cbx4O55187 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cbx4O55187 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cbx4O55187 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Cbx4O55187 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cbx4O55187 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cbx4O55187 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cbx4O55187 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cbx4O55187 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cbx4O55187 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cbx4O55187 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cbx4O55187 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cbx4O55187 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cbx4O55187 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cbx4O55187 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cbx4O55187 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cbx4O55187 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cbx4O55187 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cbx4O55187 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cbx4O55187 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cbx4O55187 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cbx4O55187 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cbx4O55187 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cbx4O55187 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cbx4O55187 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cbx4O55187 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cbx4O55187 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cbx4O55187 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cbx4O55187 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cbx4O55187 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cbx4O55187 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cbx4O55187 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cbx4O55187 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cbx4O55187 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cbx4O55187 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cbx4O55187 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cbx4O55187 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Cbx4O55187 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cbx4O55187 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cbx4O55187 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cbx4O55187 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cbx4O55187 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cbx4O55187 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cbx4O55187 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cbx4O55187 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cbx4O55187 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cbx4O55187 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cbx4O55187 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cbx4O55187 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cbx4O55187 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cbx4O55187 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cbx4O55187 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cbx4O55187 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cbx4O55187 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cbx4O55187 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cbx4O55187 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cbx4O55187 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cbx4O55187 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cbx4O55187 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cbx4O55187 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cbx4O55187 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms