Protein–RNA interactions for Protein: O55128

Sap18, Histone deacetylase complex subunit SAP18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sap18O55128 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sap18O55128 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sap18O55128 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sap18O55128 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sap18O55128 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sap18O55128 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sap18O55128 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sap18O55128 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sap18O55128 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sap18O55128 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sap18O55128 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sap18O55128 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sap18O55128 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sap18O55128 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sap18O55128 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sap18O55128 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sap18O55128 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sap18O55128 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sap18O55128 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sap18O55128 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sap18O55128 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sap18O55128 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sap18O55128 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sap18O55128 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sap18O55128 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sap18O55128 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sap18O55128 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sap18O55128 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sap18O55128 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sap18O55128 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sap18O55128 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sap18O55128 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sap18O55128 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sap18O55128 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sap18O55128 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sap18O55128 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sap18O55128 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sap18O55128 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sap18O55128 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sap18O55128 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sap18O55128 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sap18O55128 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sap18O55128 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sap18O55128 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sap18O55128 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sap18O55128 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Sap18O55128 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sap18O55128 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sap18O55128 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sap18O55128 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sap18O55128 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sap18O55128 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sap18O55128 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sap18O55128 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sap18O55128 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sap18O55128 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Sap18O55128 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sap18O55128 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sap18O55128 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sap18O55128 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sap18O55128 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sap18O55128 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Sap18O55128 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sap18O55128 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sap18O55128 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sap18O55128 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sap18O55128 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sap18O55128 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sap18O55128 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sap18O55128 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sap18O55128 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sap18O55128 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sap18O55128 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sap18O55128 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sap18O55128 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sap18O55128 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sap18O55128 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sap18O55128 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sap18O55128 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sap18O55128 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sap18O55128 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sap18O55128 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sap18O55128 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sap18O55128 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sap18O55128 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sap18O55128 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sap18O55128 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sap18O55128 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sap18O55128 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sap18O55128 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sap18O55128 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sap18O55128 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sap18O55128 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sap18O55128 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sap18O55128 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sap18O55128 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sap18O55128 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sap18O55128 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sap18O55128 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sap18O55128 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms