Protein–RNA interactions for Protein: O55013

Trappc3, Trafficking protein particle complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3O55013 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trappc3O55013 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trappc3O55013 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Trappc3O55013 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trappc3O55013 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trappc3O55013 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trappc3O55013 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trappc3O55013 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trappc3O55013 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trappc3O55013 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trappc3O55013 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trappc3O55013 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trappc3O55013 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trappc3O55013 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trappc3O55013 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trappc3O55013 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trappc3O55013 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trappc3O55013 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trappc3O55013 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trappc3O55013 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trappc3O55013 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trappc3O55013 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trappc3O55013 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trappc3O55013 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trappc3O55013 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trappc3O55013 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trappc3O55013 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trappc3O55013 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trappc3O55013 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Trappc3O55013 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trappc3O55013 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trappc3O55013 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trappc3O55013 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trappc3O55013 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trappc3O55013 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trappc3O55013 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trappc3O55013 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trappc3O55013 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trappc3O55013 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trappc3O55013 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trappc3O55013 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trappc3O55013 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trappc3O55013 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trappc3O55013 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trappc3O55013 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trappc3O55013 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trappc3O55013 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trappc3O55013 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trappc3O55013 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trappc3O55013 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Trappc3O55013 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trappc3O55013 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trappc3O55013 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trappc3O55013 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trappc3O55013 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trappc3O55013 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trappc3O55013 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trappc3O55013 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trappc3O55013 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trappc3O55013 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trappc3O55013 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trappc3O55013 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trappc3O55013 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trappc3O55013 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trappc3O55013 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trappc3O55013 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trappc3O55013 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trappc3O55013 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trappc3O55013 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trappc3O55013 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trappc3O55013 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trappc3O55013 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trappc3O55013 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Trappc3O55013 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trappc3O55013 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trappc3O55013 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trappc3O55013 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trappc3O55013 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trappc3O55013 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trappc3O55013 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trappc3O55013 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trappc3O55013 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trappc3O55013 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trappc3O55013 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trappc3O55013 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trappc3O55013 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trappc3O55013 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trappc3O55013 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trappc3O55013 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trappc3O55013 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trappc3O55013 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trappc3O55013 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trappc3O55013 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trappc3O55013 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trappc3O55013 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trappc3O55013 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trappc3O55013 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trappc3O55013 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trappc3O55013 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trappc3O55013 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms