Protein–RNA interactions for Protein: O55003

Bnip3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnip3O55003 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Bnip3O55003 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Bnip3O55003 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Bnip3O55003 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Bnip3O55003 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Bnip3O55003 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Bnip3O55003 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Bnip3O55003 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Bnip3O55003 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Bnip3O55003 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Bnip3O55003 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bnip3O55003 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Bnip3O55003 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bnip3O55003 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bnip3O55003 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bnip3O55003 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bnip3O55003 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Bnip3O55003 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Bnip3O55003 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bnip3O55003 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bnip3O55003 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bnip3O55003 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Bnip3O55003 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Bnip3O55003 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Bnip3O55003 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Bnip3O55003 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Bnip3O55003 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Bnip3O55003 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Bnip3O55003 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Bnip3O55003 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Bnip3O55003 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Bnip3O55003 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Bnip3O55003 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Bnip3O55003 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Bnip3O55003 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Bnip3O55003 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Bnip3O55003 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Bnip3O55003 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Bnip3O55003 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Bnip3O55003 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Bnip3O55003 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Bnip3O55003 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Bnip3O55003 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Bnip3O55003 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Bnip3O55003 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Bnip3O55003 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Bnip3O55003 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Bnip3O55003 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Bnip3O55003 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Bnip3O55003 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Bnip3O55003 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Bnip3O55003 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Bnip3O55003 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Bnip3O55003 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Bnip3O55003 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Bnip3O55003 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Bnip3O55003 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Bnip3O55003 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Bnip3O55003 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Bnip3O55003 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Bnip3O55003 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Bnip3O55003 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Bnip3O55003 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Bnip3O55003 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Bnip3O55003 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Bnip3O55003 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Bnip3O55003 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Bnip3O55003 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Bnip3O55003 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Bnip3O55003 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Bnip3O55003 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Bnip3O55003 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bnip3O55003 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bnip3O55003 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bnip3O55003 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bnip3O55003 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bnip3O55003 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bnip3O55003 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bnip3O55003 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bnip3O55003 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Bnip3O55003 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Bnip3O55003 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Bnip3O55003 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Bnip3O55003 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Bnip3O55003 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Bnip3O55003 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Bnip3O55003 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Bnip3O55003 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Bnip3O55003 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Bnip3O55003 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Bnip3O55003 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Bnip3O55003 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Bnip3O55003 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Bnip3O55003 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Bnip3O55003 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Bnip3O55003 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Bnip3O55003 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Bnip3O55003 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Bnip3O55003 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Bnip3O55003 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms