Protein–RNA interactions for Protein: O54956

Pole2, DNA polymerase epsilon subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole2O54956 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pole2O54956 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pole2O54956 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pole2O54956 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pole2O54956 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pole2O54956 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pole2O54956 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pole2O54956 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pole2O54956 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Pole2O54956 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pole2O54956 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pole2O54956 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pole2O54956 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pole2O54956 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Pole2O54956 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pole2O54956 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pole2O54956 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pole2O54956 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Pole2O54956 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pole2O54956 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pole2O54956 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pole2O54956 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pole2O54956 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pole2O54956 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pole2O54956 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pole2O54956 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pole2O54956 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pole2O54956 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pole2O54956 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pole2O54956 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pole2O54956 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pole2O54956 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Pole2O54956 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pole2O54956 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pole2O54956 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pole2O54956 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pole2O54956 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pole2O54956 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pole2O54956 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pole2O54956 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pole2O54956 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pole2O54956 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pole2O54956 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pole2O54956 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pole2O54956 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pole2O54956 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Pole2O54956 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pole2O54956 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pole2O54956 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pole2O54956 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pole2O54956 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pole2O54956 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pole2O54956 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pole2O54956 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pole2O54956 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pole2O54956 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pole2O54956 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pole2O54956 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pole2O54956 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pole2O54956 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pole2O54956 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pole2O54956 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pole2O54956 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pole2O54956 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pole2O54956 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pole2O54956 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pole2O54956 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pole2O54956 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pole2O54956 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pole2O54956 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pole2O54956 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pole2O54956 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pole2O54956 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pole2O54956 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pole2O54956 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pole2O54956 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pole2O54956 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pole2O54956 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Pole2O54956 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pole2O54956 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pole2O54956 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Pole2O54956 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pole2O54956 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pole2O54956 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pole2O54956 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pole2O54956 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pole2O54956 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pole2O54956 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pole2O54956 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pole2O54956 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pole2O54956 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pole2O54956 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pole2O54956 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pole2O54956 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pole2O54956 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pole2O54956 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pole2O54956 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pole2O54956 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pole2O54956 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pole2O54956 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms