Protein–RNA interactions for Protein: O54951

Sema6b, Semaphorin-6B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6bO54951 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sema6bO54951 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sema6bO54951 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sema6bO54951 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sema6bO54951 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sema6bO54951 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sema6bO54951 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sema6bO54951 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sema6bO54951 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sema6bO54951 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sema6bO54951 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sema6bO54951 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sema6bO54951 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sema6bO54951 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sema6bO54951 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sema6bO54951 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sema6bO54951 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sema6bO54951 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sema6bO54951 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Sema6bO54951 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sema6bO54951 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sema6bO54951 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sema6bO54951 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sema6bO54951 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sema6bO54951 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Sema6bO54951 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sema6bO54951 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sema6bO54951 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sema6bO54951 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sema6bO54951 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sema6bO54951 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sema6bO54951 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sema6bO54951 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Sema6bO54951 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sema6bO54951 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sema6bO54951 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sema6bO54951 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sema6bO54951 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sema6bO54951 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sema6bO54951 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sema6bO54951 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sema6bO54951 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sema6bO54951 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Sema6bO54951 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sema6bO54951 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sema6bO54951 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sema6bO54951 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sema6bO54951 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sema6bO54951 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sema6bO54951 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Sema6bO54951 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sema6bO54951 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sema6bO54951 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sema6bO54951 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sema6bO54951 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sema6bO54951 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sema6bO54951 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sema6bO54951 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Sema6bO54951 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Sema6bO54951 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sema6bO54951 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sema6bO54951 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sema6bO54951 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sema6bO54951 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sema6bO54951 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sema6bO54951 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sema6bO54951 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sema6bO54951 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sema6bO54951 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sema6bO54951 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sema6bO54951 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sema6bO54951 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Sema6bO54951 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Sema6bO54951 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sema6bO54951 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sema6bO54951 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sema6bO54951 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sema6bO54951 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sema6bO54951 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sema6bO54951 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sema6bO54951 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sema6bO54951 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sema6bO54951 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sema6bO54951 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sema6bO54951 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Sema6bO54951 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Sema6bO54951 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sema6bO54951 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sema6bO54951 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sema6bO54951 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sema6bO54951 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sema6bO54951 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sema6bO54951 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sema6bO54951 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sema6bO54951 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sema6bO54951 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sema6bO54951 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sema6bO54951 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sema6bO54951 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Sema6bO54951 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms