Protein–RNA interactions for Protein: O54833

Csnk2a2, Casein kinase II subunit alpha', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a2O54833 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Csnk2a2O54833 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Csnk2a2O54833 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Csnk2a2O54833 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Csnk2a2O54833 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Csnk2a2O54833 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Csnk2a2O54833 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Csnk2a2O54833 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Csnk2a2O54833 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Csnk2a2O54833 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Csnk2a2O54833 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Csnk2a2O54833 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Csnk2a2O54833 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Csnk2a2O54833 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Csnk2a2O54833 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Csnk2a2O54833 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Csnk2a2O54833 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Csnk2a2O54833 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Csnk2a2O54833 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Csnk2a2O54833 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Csnk2a2O54833 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Csnk2a2O54833 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Csnk2a2O54833 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Csnk2a2O54833 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Csnk2a2O54833 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Csnk2a2O54833 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Csnk2a2O54833 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Csnk2a2O54833 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Csnk2a2O54833 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Csnk2a2O54833 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Csnk2a2O54833 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Csnk2a2O54833 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Csnk2a2O54833 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Csnk2a2O54833 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Csnk2a2O54833 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Csnk2a2O54833 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Csnk2a2O54833 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Csnk2a2O54833 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Csnk2a2O54833 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Csnk2a2O54833 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Csnk2a2O54833 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Csnk2a2O54833 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Csnk2a2O54833 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Csnk2a2O54833 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Csnk2a2O54833 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Csnk2a2O54833 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Csnk2a2O54833 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Csnk2a2O54833 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Csnk2a2O54833 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Csnk2a2O54833 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Csnk2a2O54833 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Csnk2a2O54833 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Csnk2a2O54833 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Csnk2a2O54833 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Csnk2a2O54833 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Csnk2a2O54833 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Csnk2a2O54833 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Csnk2a2O54833 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Csnk2a2O54833 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Csnk2a2O54833 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Csnk2a2O54833 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Csnk2a2O54833 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Csnk2a2O54833 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Csnk2a2O54833 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Csnk2a2O54833 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Csnk2a2O54833 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Csnk2a2O54833 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Csnk2a2O54833 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Csnk2a2O54833 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Csnk2a2O54833 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Csnk2a2O54833 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Csnk2a2O54833 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Csnk2a2O54833 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Csnk2a2O54833 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Csnk2a2O54833 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Csnk2a2O54833 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Csnk2a2O54833 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Csnk2a2O54833 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Csnk2a2O54833 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Csnk2a2O54833 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Csnk2a2O54833 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Csnk2a2O54833 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Csnk2a2O54833 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Csnk2a2O54833 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Csnk2a2O54833 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Csnk2a2O54833 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Csnk2a2O54833 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Csnk2a2O54833 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Csnk2a2O54833 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Csnk2a2O54833 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Csnk2a2O54833 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Csnk2a2O54833 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Csnk2a2O54833 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Csnk2a2O54833 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Csnk2a2O54833 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Csnk2a2O54833 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Csnk2a2O54833 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Csnk2a2O54833 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Csnk2a2O54833 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Csnk2a2O54833 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms