Protein–RNA interactions for Protein: O54732

Mmp15, Matrix metalloproteinase-15, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp15O54732 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mmp15O54732 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mmp15O54732 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mmp15O54732 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mmp15O54732 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mmp15O54732 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mmp15O54732 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mmp15O54732 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mmp15O54732 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mmp15O54732 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Mmp15O54732 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mmp15O54732 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mmp15O54732 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mmp15O54732 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mmp15O54732 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mmp15O54732 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mmp15O54732 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mmp15O54732 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mmp15O54732 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Mmp15O54732 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mmp15O54732 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mmp15O54732 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mmp15O54732 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mmp15O54732 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mmp15O54732 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Mmp15O54732 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mmp15O54732 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mmp15O54732 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Mmp15O54732 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mmp15O54732 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mmp15O54732 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mmp15O54732 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mmp15O54732 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mmp15O54732 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mmp15O54732 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mmp15O54732 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mmp15O54732 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mmp15O54732 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mmp15O54732 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mmp15O54732 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mmp15O54732 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mmp15O54732 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Mmp15O54732 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mmp15O54732 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mmp15O54732 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Mmp15O54732 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mmp15O54732 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mmp15O54732 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mmp15O54732 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mmp15O54732 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mmp15O54732 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mmp15O54732 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mmp15O54732 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mmp15O54732 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mmp15O54732 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mmp15O54732 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mmp15O54732 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mmp15O54732 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mmp15O54732 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Mmp15O54732 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mmp15O54732 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mmp15O54732 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mmp15O54732 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mmp15O54732 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mmp15O54732 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mmp15O54732 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mmp15O54732 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mmp15O54732 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mmp15O54732 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mmp15O54732 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mmp15O54732 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mmp15O54732 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mmp15O54732 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mmp15O54732 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mmp15O54732 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Mmp15O54732 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mmp15O54732 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Mmp15O54732 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mmp15O54732 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mmp15O54732 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mmp15O54732 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mmp15O54732 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mmp15O54732 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mmp15O54732 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mmp15O54732 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mmp15O54732 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mmp15O54732 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mmp15O54732 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mmp15O54732 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mmp15O54732 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mmp15O54732 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mmp15O54732 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mmp15O54732 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mmp15O54732 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mmp15O54732 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mmp15O54732 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mmp15O54732 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mmp15O54732 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mmp15O54732 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mmp15O54732 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms