Protein–RNA interactions for Protein: O35716

Socs1, Suppressor of cytokine signaling 1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Socs1O35716 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Socs1O35716 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Socs1O35716 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Socs1O35716 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Socs1O35716 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Socs1O35716 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Socs1O35716 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Socs1O35716 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Socs1O35716 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Socs1O35716 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Socs1O35716 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Socs1O35716 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Socs1O35716 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Socs1O35716 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Socs1O35716 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Socs1O35716 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Socs1O35716 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Socs1O35716 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Socs1O35716 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Socs1O35716 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Socs1O35716 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Socs1O35716 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Socs1O35716 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Socs1O35716 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Socs1O35716 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Socs1O35716 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Socs1O35716 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Socs1O35716 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Socs1O35716 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Socs1O35716 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Socs1O35716 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Socs1O35716 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Socs1O35716 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Socs1O35716 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Socs1O35716 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Socs1O35716 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Socs1O35716 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Socs1O35716 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Socs1O35716 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Socs1O35716 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Socs1O35716 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Socs1O35716 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Socs1O35716 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Socs1O35716 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Socs1O35716 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Socs1O35716 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Socs1O35716 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Socs1O35716 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Socs1O35716 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Socs1O35716 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Socs1O35716 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Socs1O35716 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Socs1O35716 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Socs1O35716 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Socs1O35716 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Socs1O35716 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Socs1O35716 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Socs1O35716 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Socs1O35716 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Socs1O35716 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Socs1O35716 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Socs1O35716 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Socs1O35716 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Socs1O35716 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Socs1O35716 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Socs1O35716 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Socs1O35716 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Socs1O35716 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Socs1O35716 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Socs1O35716 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Socs1O35716 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Socs1O35716 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Socs1O35716 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Socs1O35716 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Socs1O35716 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Socs1O35716 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Socs1O35716 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Socs1O35716 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Socs1O35716 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Socs1O35716 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Socs1O35716 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Socs1O35716 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Socs1O35716 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Socs1O35716 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Socs1O35716 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Socs1O35716 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Socs1O35716 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Socs1O35716 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Socs1O35716 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Socs1O35716 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Socs1O35716 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Socs1O35716 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Socs1O35716 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Socs1O35716 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Socs1O35716 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Socs1O35716 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Socs1O35716 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Socs1O35716 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Socs1O35716 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Socs1O35716 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms