Protein–RNA interactions for Protein: O35638

Stag2, Cohesin subunit SA-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag2O35638 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Stag2O35638 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Stag2O35638 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Stag2O35638 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Stag2O35638 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Stag2O35638 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Stag2O35638 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Stag2O35638 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Stag2O35638 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Stag2O35638 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Stag2O35638 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Stag2O35638 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Stag2O35638 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Stag2O35638 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Stag2O35638 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Stag2O35638 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Stag2O35638 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Stag2O35638 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Stag2O35638 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Stag2O35638 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Stag2O35638 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Stag2O35638 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Stag2O35638 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Stag2O35638 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Stag2O35638 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Stag2O35638 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Stag2O35638 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Stag2O35638 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Stag2O35638 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Stag2O35638 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Stag2O35638 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Stag2O35638 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Stag2O35638 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Stag2O35638 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Stag2O35638 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Stag2O35638 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Stag2O35638 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Stag2O35638 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Stag2O35638 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Stag2O35638 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Stag2O35638 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Stag2O35638 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Stag2O35638 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Stag2O35638 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Stag2O35638 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Stag2O35638 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Stag2O35638 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Stag2O35638 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Stag2O35638 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Stag2O35638 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Stag2O35638 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Stag2O35638 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Stag2O35638 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Stag2O35638 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Stag2O35638 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Stag2O35638 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Stag2O35638 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Stag2O35638 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Stag2O35638 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Stag2O35638 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Stag2O35638 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Stag2O35638 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Stag2O35638 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Stag2O35638 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Stag2O35638 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Stag2O35638 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Stag2O35638 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Stag2O35638 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Stag2O35638 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Stag2O35638 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Stag2O35638 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Stag2O35638 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Stag2O35638 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Stag2O35638 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Stag2O35638 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Stag2O35638 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Stag2O35638 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Stag2O35638 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Stag2O35638 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Stag2O35638 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Stag2O35638 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Stag2O35638 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Stag2O35638 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Stag2O35638 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Stag2O35638 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Stag2O35638 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Stag2O35638 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Stag2O35638 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Stag2O35638 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Stag2O35638 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Stag2O35638 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Stag2O35638 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Stag2O35638 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Stag2O35638 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Stag2O35638 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Stag2O35638 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Stag2O35638 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Stag2O35638 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Stag2O35638 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Stag2O35638 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms