Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Opn1mwO35599 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Opn1mwO35599 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Opn1mwO35599 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Opn1mwO35599 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Opn1mwO35599 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Opn1mwO35599 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Opn1mwO35599 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Opn1mwO35599 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Opn1mwO35599 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Opn1mwO35599 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Opn1mwO35599 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Opn1mwO35599 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Opn1mwO35599 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Opn1mwO35599 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Opn1mwO35599 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Opn1mwO35599 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Opn1mwO35599 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Opn1mwO35599 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Opn1mwO35599 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Opn1mwO35599 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Opn1mwO35599 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Opn1mwO35599 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Opn1mwO35599 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Opn1mwO35599 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Opn1mwO35599 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Opn1mwO35599 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Opn1mwO35599 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Opn1mwO35599 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Opn1mwO35599 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Opn1mwO35599 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Opn1mwO35599 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Opn1mwO35599 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Opn1mwO35599 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Opn1mwO35599 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Opn1mwO35599 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Opn1mwO35599 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Opn1mwO35599 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Opn1mwO35599 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Opn1mwO35599 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Opn1mwO35599 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Opn1mwO35599 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Opn1mwO35599 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Opn1mwO35599 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Opn1mwO35599 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Opn1mwO35599 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Opn1mwO35599 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Opn1mwO35599 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Opn1mwO35599 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Opn1mwO35599 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Opn1mwO35599 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Opn1mwO35599 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Opn1mwO35599 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Opn1mwO35599 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Opn1mwO35599 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Opn1mwO35599 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Opn1mwO35599 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Opn1mwO35599 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Opn1mwO35599 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Opn1mwO35599 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Opn1mwO35599 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Opn1mwO35599 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Opn1mwO35599 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Opn1mwO35599 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Opn1mwO35599 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Opn1mwO35599 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Opn1mwO35599 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Opn1mwO35599 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Opn1mwO35599 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Opn1mwO35599 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Opn1mwO35599 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Opn1mwO35599 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Opn1mwO35599 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Opn1mwO35599 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Opn1mwO35599 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Opn1mwO35599 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Opn1mwO35599 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Opn1mwO35599 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Opn1mwO35599 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Opn1mwO35599 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Opn1mwO35599 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Opn1mwO35599 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Opn1mwO35599 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Opn1mwO35599 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Opn1mwO35599 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Opn1mwO35599 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Opn1mwO35599 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Opn1mwO35599 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Opn1mwO35599 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Opn1mwO35599 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Opn1mwO35599 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Opn1mwO35599 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Opn1mwO35599 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Opn1mwO35599 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Opn1mwO35599 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Opn1mwO35599 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Opn1mwO35599 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Opn1mwO35599 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Opn1mwO35599 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Opn1mwO35599 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms