Protein–RNA interactions for Protein: O35526

Stx1a, Syntaxin-1A, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx1aO35526 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Stx1aO35526 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Stx1aO35526 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Stx1aO35526 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Stx1aO35526 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Stx1aO35526 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Stx1aO35526 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Stx1aO35526 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Stx1aO35526 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Stx1aO35526 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Stx1aO35526 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Stx1aO35526 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Stx1aO35526 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Stx1aO35526 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Stx1aO35526 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Stx1aO35526 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Stx1aO35526 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Stx1aO35526 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Stx1aO35526 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Stx1aO35526 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Stx1aO35526 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Stx1aO35526 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Stx1aO35526 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Stx1aO35526 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Stx1aO35526 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Stx1aO35526 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Stx1aO35526 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Stx1aO35526 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Stx1aO35526 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Stx1aO35526 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Stx1aO35526 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Stx1aO35526 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Stx1aO35526 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Stx1aO35526 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Stx1aO35526 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Stx1aO35526 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Stx1aO35526 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Stx1aO35526 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Stx1aO35526 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Stx1aO35526 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Stx1aO35526 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Stx1aO35526 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Stx1aO35526 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Stx1aO35526 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Stx1aO35526 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Stx1aO35526 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Stx1aO35526 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Stx1aO35526 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Stx1aO35526 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Stx1aO35526 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Stx1aO35526 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Stx1aO35526 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Stx1aO35526 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Stx1aO35526 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Stx1aO35526 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Stx1aO35526 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Stx1aO35526 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Stx1aO35526 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Stx1aO35526 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Stx1aO35526 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Stx1aO35526 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Stx1aO35526 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Stx1aO35526 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Stx1aO35526 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Stx1aO35526 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Stx1aO35526 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Stx1aO35526 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Stx1aO35526 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Stx1aO35526 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Stx1aO35526 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Stx1aO35526 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Stx1aO35526 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Stx1aO35526 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Stx1aO35526 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Stx1aO35526 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Stx1aO35526 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Stx1aO35526 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stx1aO35526 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stx1aO35526 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stx1aO35526 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stx1aO35526 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stx1aO35526 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stx1aO35526 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stx1aO35526 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stx1aO35526 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stx1aO35526 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stx1aO35526 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stx1aO35526 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stx1aO35526 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stx1aO35526 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stx1aO35526 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stx1aO35526 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stx1aO35526 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stx1aO35526 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stx1aO35526 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stx1aO35526 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stx1aO35526 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stx1aO35526 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stx1aO35526 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stx1aO35526 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms