Protein–RNA interactions for Protein: O35448

Ppt2, Lysosomal thioesterase PPT2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppt2O35448 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ppt2O35448 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ppt2O35448 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ppt2O35448 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ppt2O35448 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ppt2O35448 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ppt2O35448 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ppt2O35448 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ppt2O35448 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ppt2O35448 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ppt2O35448 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ppt2O35448 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ppt2O35448 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ppt2O35448 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ppt2O35448 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ppt2O35448 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ppt2O35448 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ppt2O35448 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ppt2O35448 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ppt2O35448 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ppt2O35448 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ppt2O35448 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ppt2O35448 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ppt2O35448 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ppt2O35448 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ppt2O35448 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ppt2O35448 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ppt2O35448 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ppt2O35448 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ppt2O35448 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ppt2O35448 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ppt2O35448 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ppt2O35448 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ppt2O35448 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ppt2O35448 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ppt2O35448 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ppt2O35448 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ppt2O35448 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ppt2O35448 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ppt2O35448 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ppt2O35448 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ppt2O35448 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ppt2O35448 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ppt2O35448 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ppt2O35448 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ppt2O35448 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ppt2O35448 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ppt2O35448 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ppt2O35448 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ppt2O35448 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ppt2O35448 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ppt2O35448 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ppt2O35448 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ppt2O35448 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ppt2O35448 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ppt2O35448 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ppt2O35448 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ppt2O35448 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ppt2O35448 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ppt2O35448 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ppt2O35448 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ppt2O35448 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ppt2O35448 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ppt2O35448 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ppt2O35448 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ppt2O35448 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ppt2O35448 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ppt2O35448 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ppt2O35448 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ppt2O35448 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ppt2O35448 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ppt2O35448 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ppt2O35448 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ppt2O35448 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ppt2O35448 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ppt2O35448 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ppt2O35448 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ppt2O35448 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ppt2O35448 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ppt2O35448 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ppt2O35448 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ppt2O35448 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ppt2O35448 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ppt2O35448 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ppt2O35448 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ppt2O35448 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ppt2O35448 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ppt2O35448 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ppt2O35448 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ppt2O35448 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ppt2O35448 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ppt2O35448 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ppt2O35448 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ppt2O35448 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ppt2O35448 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ppt2O35448 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ppt2O35448 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ppt2O35448 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ppt2O35448 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ppt2O35448 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms