Protein–RNA interactions for Protein: O35427

Crcp, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC9, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrcpO35427 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CrcpO35427 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CrcpO35427 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CrcpO35427 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CrcpO35427 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CrcpO35427 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CrcpO35427 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CrcpO35427 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CrcpO35427 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CrcpO35427 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CrcpO35427 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CrcpO35427 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CrcpO35427 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CrcpO35427 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CrcpO35427 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CrcpO35427 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CrcpO35427 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CrcpO35427 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CrcpO35427 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CrcpO35427 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CrcpO35427 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CrcpO35427 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CrcpO35427 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CrcpO35427 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CrcpO35427 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CrcpO35427 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CrcpO35427 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CrcpO35427 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CrcpO35427 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CrcpO35427 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CrcpO35427 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CrcpO35427 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CrcpO35427 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CrcpO35427 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CrcpO35427 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CrcpO35427 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CrcpO35427 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CrcpO35427 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CrcpO35427 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CrcpO35427 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CrcpO35427 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CrcpO35427 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CrcpO35427 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CrcpO35427 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CrcpO35427 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CrcpO35427 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CrcpO35427 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CrcpO35427 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CrcpO35427 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CrcpO35427 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CrcpO35427 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CrcpO35427 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CrcpO35427 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CrcpO35427 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CrcpO35427 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CrcpO35427 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CrcpO35427 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CrcpO35427 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CrcpO35427 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CrcpO35427 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CrcpO35427 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CrcpO35427 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CrcpO35427 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CrcpO35427 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CrcpO35427 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CrcpO35427 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CrcpO35427 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CrcpO35427 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CrcpO35427 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CrcpO35427 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CrcpO35427 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CrcpO35427 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CrcpO35427 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CrcpO35427 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CrcpO35427 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CrcpO35427 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CrcpO35427 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CrcpO35427 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CrcpO35427 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CrcpO35427 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CrcpO35427 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CrcpO35427 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CrcpO35427 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CrcpO35427 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CrcpO35427 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CrcpO35427 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CrcpO35427 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CrcpO35427 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CrcpO35427 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CrcpO35427 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CrcpO35427 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CrcpO35427 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CrcpO35427 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CrcpO35427 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CrcpO35427 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CrcpO35427 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CrcpO35427 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CrcpO35427 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CrcpO35427 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CrcpO35427 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms