Protein–RNA interactions for Protein: O35392

Foxd2, Forkhead box protein D2, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd2O35392 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Foxd2O35392 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Foxd2O35392 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Foxd2O35392 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Foxd2O35392 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Foxd2O35392 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Foxd2O35392 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Foxd2O35392 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Foxd2O35392 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Foxd2O35392 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Foxd2O35392 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Foxd2O35392 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Foxd2O35392 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Foxd2O35392 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Foxd2O35392 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Foxd2O35392 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Foxd2O35392 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Foxd2O35392 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Foxd2O35392 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Foxd2O35392 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Foxd2O35392 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Foxd2O35392 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Foxd2O35392 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Foxd2O35392 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Foxd2O35392 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Foxd2O35392 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Foxd2O35392 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Foxd2O35392 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Foxd2O35392 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Foxd2O35392 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Foxd2O35392 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Foxd2O35392 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Foxd2O35392 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Foxd2O35392 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Foxd2O35392 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Foxd2O35392 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Foxd2O35392 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Foxd2O35392 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Foxd2O35392 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Foxd2O35392 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Foxd2O35392 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Foxd2O35392 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Foxd2O35392 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Foxd2O35392 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Foxd2O35392 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Foxd2O35392 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Foxd2O35392 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Foxd2O35392 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Foxd2O35392 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Foxd2O35392 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Foxd2O35392 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Foxd2O35392 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Foxd2O35392 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Foxd2O35392 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Foxd2O35392 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Foxd2O35392 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Foxd2O35392 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Foxd2O35392 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Foxd2O35392 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Foxd2O35392 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Foxd2O35392 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Foxd2O35392 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Foxd2O35392 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Foxd2O35392 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Foxd2O35392 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Foxd2O35392 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Foxd2O35392 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Foxd2O35392 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Foxd2O35392 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Foxd2O35392 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Foxd2O35392 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Foxd2O35392 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Foxd2O35392 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Foxd2O35392 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Foxd2O35392 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Foxd2O35392 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Foxd2O35392 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Foxd2O35392 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Foxd2O35392 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Foxd2O35392 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Foxd2O35392 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Foxd2O35392 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Foxd2O35392 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Foxd2O35392 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Foxd2O35392 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Foxd2O35392 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Foxd2O35392 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Foxd2O35392 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Foxd2O35392 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Foxd2O35392 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Foxd2O35392 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Foxd2O35392 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Foxd2O35392 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Foxd2O35392 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Foxd2O35392 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Foxd2O35392 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Foxd2O35392 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Foxd2O35392 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Foxd2O35392 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Foxd2O35392 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms