Protein–RNA interactions for Protein: O35386

Phyh, Phytanoyl-CoA dioxygenase, peroxisomal, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PhyhO35386 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PhyhO35386 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PhyhO35386 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PhyhO35386 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PhyhO35386 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PhyhO35386 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PhyhO35386 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PhyhO35386 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PhyhO35386 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PhyhO35386 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PhyhO35386 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PhyhO35386 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PhyhO35386 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PhyhO35386 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PhyhO35386 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PhyhO35386 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PhyhO35386 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PhyhO35386 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PhyhO35386 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PhyhO35386 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PhyhO35386 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PhyhO35386 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PhyhO35386 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PhyhO35386 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PhyhO35386 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PhyhO35386 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PhyhO35386 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PhyhO35386 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PhyhO35386 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PhyhO35386 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PhyhO35386 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PhyhO35386 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PhyhO35386 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PhyhO35386 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PhyhO35386 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PhyhO35386 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PhyhO35386 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PhyhO35386 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PhyhO35386 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PhyhO35386 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PhyhO35386 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PhyhO35386 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PhyhO35386 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PhyhO35386 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PhyhO35386 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PhyhO35386 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PhyhO35386 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PhyhO35386 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PhyhO35386 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PhyhO35386 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PhyhO35386 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PhyhO35386 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PhyhO35386 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PhyhO35386 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PhyhO35386 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PhyhO35386 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PhyhO35386 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PhyhO35386 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PhyhO35386 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PhyhO35386 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PhyhO35386 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PhyhO35386 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PhyhO35386 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PhyhO35386 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PhyhO35386 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PhyhO35386 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PhyhO35386 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PhyhO35386 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PhyhO35386 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PhyhO35386 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PhyhO35386 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PhyhO35386 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PhyhO35386 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PhyhO35386 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PhyhO35386 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PhyhO35386 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PhyhO35386 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PhyhO35386 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PhyhO35386 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PhyhO35386 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PhyhO35386 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PhyhO35386 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PhyhO35386 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PhyhO35386 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PhyhO35386 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PhyhO35386 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PhyhO35386 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PhyhO35386 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PhyhO35386 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PhyhO35386 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PhyhO35386 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PhyhO35386 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PhyhO35386 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PhyhO35386 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PhyhO35386 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PhyhO35386 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PhyhO35386 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PhyhO35386 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PhyhO35386 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PhyhO35386 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms