Protein–RNA interactions for Protein: O35379

Abcc1, Multidrug resistance-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc1O35379 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
Abcc1O35379 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
Abcc1O35379 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
Abcc1O35379 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Abcc1O35379 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Abcc1O35379 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Abcc1O35379 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Abcc1O35379 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Abcc1O35379 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Abcc1O35379 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Abcc1O35379 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Abcc1O35379 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Abcc1O35379 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
Abcc1O35379 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Abcc1O35379 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Abcc1O35379 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Abcc1O35379 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Abcc1O35379 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Abcc1O35379 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Abcc1O35379 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Abcc1O35379 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Abcc1O35379 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Abcc1O35379 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Abcc1O35379 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Abcc1O35379 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Abcc1O35379 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Abcc1O35379 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Abcc1O35379 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Abcc1O35379 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Abcc1O35379 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Abcc1O35379 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
Abcc1O35379 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Abcc1O35379 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Abcc1O35379 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Abcc1O35379 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Abcc1O35379 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Abcc1O35379 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Abcc1O35379 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Abcc1O35379 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Abcc1O35379 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Abcc1O35379 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Abcc1O35379 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Abcc1O35379 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.34
Abcc1O35379 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Abcc1O35379 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.34
Abcc1O35379 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Abcc1O35379 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Abcc1O35379 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Abcc1O35379 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Abcc1O35379 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Abcc1O35379 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Abcc1O35379 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Abcc1O35379 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Abcc1O35379 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Abcc1O35379 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Abcc1O35379 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Abcc1O35379 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Abcc1O35379 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Abcc1O35379 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Abcc1O35379 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Abcc1O35379 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Abcc1O35379 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Abcc1O35379 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Abcc1O35379 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Abcc1O35379 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Abcc1O35379 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
Abcc1O35379 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Abcc1O35379 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Abcc1O35379 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Abcc1O35379 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Abcc1O35379 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Abcc1O35379 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Abcc1O35379 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Abcc1O35379 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Abcc1O35379 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Abcc1O35379 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Abcc1O35379 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Abcc1O35379 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Abcc1O35379 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Abcc1O35379 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Abcc1O35379 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Abcc1O35379 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Abcc1O35379 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Abcc1O35379 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Abcc1O35379 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Abcc1O35379 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Abcc1O35379 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
Abcc1O35379 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Abcc1O35379 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Abcc1O35379 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Abcc1O35379 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Abcc1O35379 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Abcc1O35379 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Abcc1O35379 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Abcc1O35379 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
Abcc1O35379 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Abcc1O35379 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Abcc1O35379 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Abcc1O35379 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Abcc1O35379 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms