Protein–RNA interactions for Protein: O09000

Ncoa3, Nuclear receptor coactivator 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncoa3O09000 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ncoa3O09000 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ncoa3O09000 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Ncoa3O09000 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ncoa3O09000 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ncoa3O09000 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ncoa3O09000 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ncoa3O09000 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ncoa3O09000 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ncoa3O09000 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ncoa3O09000 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ncoa3O09000 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ncoa3O09000 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ncoa3O09000 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ncoa3O09000 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ncoa3O09000 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ncoa3O09000 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ncoa3O09000 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ncoa3O09000 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ncoa3O09000 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ncoa3O09000 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ncoa3O09000 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Ncoa3O09000 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Ncoa3O09000 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Ncoa3O09000 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Ncoa3O09000 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Ncoa3O09000 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ncoa3O09000 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ncoa3O09000 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ncoa3O09000 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ncoa3O09000 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ncoa3O09000 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ncoa3O09000 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ncoa3O09000 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ncoa3O09000 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ncoa3O09000 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ncoa3O09000 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ncoa3O09000 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ncoa3O09000 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ncoa3O09000 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ncoa3O09000 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ncoa3O09000 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ncoa3O09000 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Ncoa3O09000 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Ncoa3O09000 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ncoa3O09000 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ncoa3O09000 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Ncoa3O09000 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ncoa3O09000 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ncoa3O09000 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ncoa3O09000 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ncoa3O09000 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ncoa3O09000 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ncoa3O09000 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ncoa3O09000 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Ncoa3O09000 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ncoa3O09000 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ncoa3O09000 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ncoa3O09000 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ncoa3O09000 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ncoa3O09000 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ncoa3O09000 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ncoa3O09000 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Ncoa3O09000 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Ncoa3O09000 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Ncoa3O09000 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ncoa3O09000 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ncoa3O09000 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ncoa3O09000 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ncoa3O09000 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Ncoa3O09000 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ncoa3O09000 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ncoa3O09000 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ncoa3O09000 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ncoa3O09000 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ncoa3O09000 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ncoa3O09000 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ncoa3O09000 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ncoa3O09000 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ncoa3O09000 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ncoa3O09000 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ncoa3O09000 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ncoa3O09000 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ncoa3O09000 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ncoa3O09000 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Ncoa3O09000 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ncoa3O09000 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Ncoa3O09000 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ncoa3O09000 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ncoa3O09000 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ncoa3O09000 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ncoa3O09000 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ncoa3O09000 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Ncoa3O09000 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ncoa3O09000 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ncoa3O09000 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ncoa3O09000 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ncoa3O09000 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ncoa3O09000 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ncoa3O09000 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms