Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Eftud2O08810 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Eftud2O08810 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Eftud2O08810 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Eftud2O08810 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Eftud2O08810 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Eftud2O08810 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Eftud2O08810 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Eftud2O08810 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Eftud2O08810 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Eftud2O08810 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Eftud2O08810 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Eftud2O08810 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Eftud2O08810 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Eftud2O08810 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Eftud2O08810 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Eftud2O08810 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Eftud2O08810 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Eftud2O08810 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Eftud2O08810 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Eftud2O08810 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Eftud2O08810 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Eftud2O08810 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Eftud2O08810 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Eftud2O08810 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Eftud2O08810 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Eftud2O08810 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Eftud2O08810 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Eftud2O08810 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Eftud2O08810 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Eftud2O08810 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Eftud2O08810 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Eftud2O08810 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Eftud2O08810 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Eftud2O08810 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Eftud2O08810 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Eftud2O08810 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Eftud2O08810 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Eftud2O08810 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Eftud2O08810 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Eftud2O08810 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Eftud2O08810 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Eftud2O08810 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Eftud2O08810 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Eftud2O08810 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Eftud2O08810 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Eftud2O08810 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Eftud2O08810 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Eftud2O08810 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Eftud2O08810 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Eftud2O08810 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Eftud2O08810 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Eftud2O08810 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Eftud2O08810 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Eftud2O08810 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Eftud2O08810 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Eftud2O08810 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Eftud2O08810 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Eftud2O08810 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Eftud2O08810 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Eftud2O08810 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Eftud2O08810 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Eftud2O08810 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Eftud2O08810 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Eftud2O08810 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Eftud2O08810 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Eftud2O08810 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Eftud2O08810 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Eftud2O08810 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Eftud2O08810 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Eftud2O08810 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Eftud2O08810 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Eftud2O08810 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Eftud2O08810 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Eftud2O08810 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Eftud2O08810 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Eftud2O08810 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Eftud2O08810 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Eftud2O08810 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Eftud2O08810 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Eftud2O08810 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Eftud2O08810 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Eftud2O08810 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Eftud2O08810 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Eftud2O08810 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Eftud2O08810 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Eftud2O08810 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Eftud2O08810 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Eftud2O08810 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Eftud2O08810 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Eftud2O08810 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Eftud2O08810 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Eftud2O08810 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Eftud2O08810 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Eftud2O08810 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Eftud2O08810 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Eftud2O08810 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Eftud2O08810 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Eftud2O08810 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Eftud2O08810 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms