Protein–RNA interactions for Protein: O08686

Barx2, Homeobox protein BarH-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barx2O08686 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Barx2O08686 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Barx2O08686 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Barx2O08686 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Barx2O08686 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Barx2O08686 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Barx2O08686 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Barx2O08686 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Barx2O08686 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Barx2O08686 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Barx2O08686 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Barx2O08686 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Barx2O08686 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Barx2O08686 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Barx2O08686 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Barx2O08686 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Barx2O08686 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Barx2O08686 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Barx2O08686 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Barx2O08686 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Barx2O08686 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Barx2O08686 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Barx2O08686 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Barx2O08686 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Barx2O08686 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Barx2O08686 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Barx2O08686 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Barx2O08686 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Barx2O08686 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Barx2O08686 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Barx2O08686 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Barx2O08686 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Barx2O08686 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Barx2O08686 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Barx2O08686 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Barx2O08686 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Barx2O08686 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Barx2O08686 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Barx2O08686 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Barx2O08686 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Barx2O08686 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Barx2O08686 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Barx2O08686 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Barx2O08686 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Barx2O08686 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Barx2O08686 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Barx2O08686 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Barx2O08686 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Barx2O08686 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Barx2O08686 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Barx2O08686 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Barx2O08686 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Barx2O08686 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Barx2O08686 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Barx2O08686 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Barx2O08686 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Barx2O08686 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Barx2O08686 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Barx2O08686 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Barx2O08686 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Barx2O08686 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Barx2O08686 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Barx2O08686 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Barx2O08686 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Barx2O08686 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Barx2O08686 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Barx2O08686 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Barx2O08686 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Barx2O08686 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Barx2O08686 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Barx2O08686 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Barx2O08686 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Barx2O08686 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Barx2O08686 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Barx2O08686 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Barx2O08686 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Barx2O08686 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Barx2O08686 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Barx2O08686 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Barx2O08686 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Barx2O08686 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Barx2O08686 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Barx2O08686 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Barx2O08686 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Barx2O08686 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Barx2O08686 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Barx2O08686 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Barx2O08686 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Barx2O08686 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Barx2O08686 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Barx2O08686 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Barx2O08686 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Barx2O08686 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Barx2O08686 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Barx2O08686 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Barx2O08686 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Barx2O08686 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Barx2O08686 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Barx2O08686 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Barx2O08686 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms