Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MsmbO08540 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MsmbO08540 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MsmbO08540 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MsmbO08540 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MsmbO08540 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MsmbO08540 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MsmbO08540 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MsmbO08540 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MsmbO08540 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MsmbO08540 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MsmbO08540 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MsmbO08540 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MsmbO08540 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MsmbO08540 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MsmbO08540 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MsmbO08540 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MsmbO08540 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MsmbO08540 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MsmbO08540 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
MsmbO08540 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MsmbO08540 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MsmbO08540 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MsmbO08540 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MsmbO08540 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MsmbO08540 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MsmbO08540 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MsmbO08540 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MsmbO08540 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
MsmbO08540 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
MsmbO08540 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MsmbO08540 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MsmbO08540 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MsmbO08540 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MsmbO08540 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MsmbO08540 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
MsmbO08540 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MsmbO08540 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
MsmbO08540 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MsmbO08540 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MsmbO08540 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MsmbO08540 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MsmbO08540 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MsmbO08540 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MsmbO08540 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MsmbO08540 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
MsmbO08540 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
MsmbO08540 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MsmbO08540 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MsmbO08540 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MsmbO08540 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MsmbO08540 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MsmbO08540 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MsmbO08540 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MsmbO08540 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MsmbO08540 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MsmbO08540 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MsmbO08540 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MsmbO08540 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MsmbO08540 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MsmbO08540 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MsmbO08540 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MsmbO08540 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MsmbO08540 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MsmbO08540 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MsmbO08540 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MsmbO08540 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MsmbO08540 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MsmbO08540 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MsmbO08540 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MsmbO08540 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MsmbO08540 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MsmbO08540 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MsmbO08540 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MsmbO08540 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MsmbO08540 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MsmbO08540 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MsmbO08540 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
MsmbO08540 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MsmbO08540 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MsmbO08540 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MsmbO08540 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MsmbO08540 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MsmbO08540 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MsmbO08540 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MsmbO08540 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MsmbO08540 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MsmbO08540 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
MsmbO08540 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MsmbO08540 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MsmbO08540 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MsmbO08540 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MsmbO08540 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MsmbO08540 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MsmbO08540 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MsmbO08540 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MsmbO08540 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MsmbO08540 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MsmbO08540 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MsmbO08540 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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