Protein–RNA interactions for Protein: L7N244

Gm20878, Predicted gene, 20878, mousemouse

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Length 103 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20878L7N244 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm20878L7N244 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm20878L7N244 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm20878L7N244 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm20878L7N244 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm20878L7N244 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm20878L7N244 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm20878L7N244 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm20878L7N244 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm20878L7N244 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm20878L7N244 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm20878L7N244 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm20878L7N244 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm20878L7N244 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm20878L7N244 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm20878L7N244 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm20878L7N244 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm20878L7N244 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm20878L7N244 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm20878L7N244 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm20878L7N244 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm20878L7N244 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm20878L7N244 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm20878L7N244 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm20878L7N244 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm20878L7N244 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm20878L7N244 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm20878L7N244 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm20878L7N244 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm20878L7N244 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm20878L7N244 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm20878L7N244 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm20878L7N244 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm20878L7N244 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm20878L7N244 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm20878L7N244 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm20878L7N244 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm20878L7N244 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm20878L7N244 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm20878L7N244 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm20878L7N244 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm20878L7N244 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm20878L7N244 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm20878L7N244 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm20878L7N244 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm20878L7N244 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm20878L7N244 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm20878L7N244 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm20878L7N244 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm20878L7N244 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm20878L7N244 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm20878L7N244 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm20878L7N244 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm20878L7N244 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm20878L7N244 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm20878L7N244 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm20878L7N244 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm20878L7N244 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm20878L7N244 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm20878L7N244 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm20878L7N244 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm20878L7N244 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm20878L7N244 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm20878L7N244 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm20878L7N244 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm20878L7N244 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm20878L7N244 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm20878L7N244 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm20878L7N244 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm20878L7N244 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm20878L7N244 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm20878L7N244 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm20878L7N244 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm20878L7N244 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm20878L7N244 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm20878L7N244 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm20878L7N244 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm20878L7N244 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm20878L7N244 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm20878L7N244 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm20878L7N244 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm20878L7N244 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm20878L7N244 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm20878L7N244 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm20878L7N244 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm20878L7N244 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm20878L7N244 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm20878L7N244 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm20878L7N244 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm20878L7N244 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm20878L7N244 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm20878L7N244 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm20878L7N244 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm20878L7N244 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm20878L7N244 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm20878L7N244 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm20878L7N244 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm20878L7N244 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm20878L7N244 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm20878L7N244 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
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