Protein–RNA interactions for Protein: J9JI28

Vwa3b, von Willebrand factor A domain-containing 3B, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwa3bJ9JI28 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vwa3bJ9JI28 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vwa3bJ9JI28 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vwa3bJ9JI28 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vwa3bJ9JI28 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vwa3bJ9JI28 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vwa3bJ9JI28 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vwa3bJ9JI28 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vwa3bJ9JI28 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vwa3bJ9JI28 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vwa3bJ9JI28 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vwa3bJ9JI28 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vwa3bJ9JI28 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vwa3bJ9JI28 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vwa3bJ9JI28 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Vwa3bJ9JI28 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vwa3bJ9JI28 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vwa3bJ9JI28 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vwa3bJ9JI28 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vwa3bJ9JI28 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vwa3bJ9JI28 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vwa3bJ9JI28 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vwa3bJ9JI28 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vwa3bJ9JI28 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vwa3bJ9JI28 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vwa3bJ9JI28 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vwa3bJ9JI28 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vwa3bJ9JI28 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vwa3bJ9JI28 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vwa3bJ9JI28 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vwa3bJ9JI28 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vwa3bJ9JI28 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vwa3bJ9JI28 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vwa3bJ9JI28 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vwa3bJ9JI28 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vwa3bJ9JI28 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vwa3bJ9JI28 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vwa3bJ9JI28 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Vwa3bJ9JI28 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Vwa3bJ9JI28 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Vwa3bJ9JI28 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Vwa3bJ9JI28 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vwa3bJ9JI28 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vwa3bJ9JI28 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vwa3bJ9JI28 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vwa3bJ9JI28 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vwa3bJ9JI28 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vwa3bJ9JI28 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vwa3bJ9JI28 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vwa3bJ9JI28 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vwa3bJ9JI28 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vwa3bJ9JI28 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vwa3bJ9JI28 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Vwa3bJ9JI28 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vwa3bJ9JI28 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vwa3bJ9JI28 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vwa3bJ9JI28 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vwa3bJ9JI28 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vwa3bJ9JI28 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vwa3bJ9JI28 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vwa3bJ9JI28 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vwa3bJ9JI28 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vwa3bJ9JI28 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vwa3bJ9JI28 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vwa3bJ9JI28 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vwa3bJ9JI28 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vwa3bJ9JI28 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vwa3bJ9JI28 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vwa3bJ9JI28 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vwa3bJ9JI28 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vwa3bJ9JI28 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Vwa3bJ9JI28 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vwa3bJ9JI28 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vwa3bJ9JI28 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vwa3bJ9JI28 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vwa3bJ9JI28 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vwa3bJ9JI28 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vwa3bJ9JI28 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vwa3bJ9JI28 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vwa3bJ9JI28 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vwa3bJ9JI28 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vwa3bJ9JI28 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vwa3bJ9JI28 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vwa3bJ9JI28 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vwa3bJ9JI28 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vwa3bJ9JI28 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vwa3bJ9JI28 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vwa3bJ9JI28 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vwa3bJ9JI28 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Vwa3bJ9JI28 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Vwa3bJ9JI28 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vwa3bJ9JI28 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vwa3bJ9JI28 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vwa3bJ9JI28 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vwa3bJ9JI28 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vwa3bJ9JI28 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vwa3bJ9JI28 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vwa3bJ9JI28 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vwa3bJ9JI28 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Vwa3bJ9JI28 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms