Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ23

Gm21310, Predicted gene, 21310, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21310J3QQ23 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm21310J3QQ23 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm21310J3QQ23 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm21310J3QQ23 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm21310J3QQ23 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm21310J3QQ23 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm21310J3QQ23 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm21310J3QQ23 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm21310J3QQ23 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21310J3QQ23 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21310J3QQ23 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21310J3QQ23 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21310J3QQ23 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21310J3QQ23 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21310J3QQ23 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21310J3QQ23 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21310J3QQ23 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21310J3QQ23 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21310J3QQ23 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21310J3QQ23 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21310J3QQ23 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21310J3QQ23 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21310J3QQ23 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21310J3QQ23 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21310J3QQ23 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21310J3QQ23 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21310J3QQ23 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21310J3QQ23 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21310J3QQ23 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21310J3QQ23 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21310J3QQ23 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21310J3QQ23 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Gm21310J3QQ23 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21310J3QQ23 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21310J3QQ23 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21310J3QQ23 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21310J3QQ23 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21310J3QQ23 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21310J3QQ23 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21310J3QQ23 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21310J3QQ23 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21310J3QQ23 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21310J3QQ23 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21310J3QQ23 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21310J3QQ23 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21310J3QQ23 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21310J3QQ23 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21310J3QQ23 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21310J3QQ23 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21310J3QQ23 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21310J3QQ23 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21310J3QQ23 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21310J3QQ23 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Gm21310J3QQ23 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21310J3QQ23 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21310J3QQ23 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21310J3QQ23 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21310J3QQ23 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Gm21310J3QQ23 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
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Gm21310J3QQ23 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21310J3QQ23 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Gm21310J3QQ23 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21310J3QQ23 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21310J3QQ23 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21310J3QQ23 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Gm21310J3QQ23 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21310J3QQ23 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21310J3QQ23 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21310J3QQ23 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21310J3QQ23 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21310J3QQ23 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21310J3QQ23 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21310J3QQ23 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21310J3QQ23 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21310J3QQ23 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21310J3QQ23 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21310J3QQ23 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21310J3QQ23 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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