Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm2056J3QQ02 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm2056J3QQ02 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm2056J3QQ02 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm2056J3QQ02 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm2056J3QQ02 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm2056J3QQ02 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm2056J3QQ02 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm2056J3QQ02 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm2056J3QQ02 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm2056J3QQ02 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm2056J3QQ02 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm2056J3QQ02 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm2056J3QQ02 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm2056J3QQ02 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm2056J3QQ02 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm2056J3QQ02 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm2056J3QQ02 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm2056J3QQ02 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm2056J3QQ02 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm2056J3QQ02 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm2056J3QQ02 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm2056J3QQ02 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm2056J3QQ02 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm2056J3QQ02 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm2056J3QQ02 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm2056J3QQ02 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm2056J3QQ02 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm2056J3QQ02 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm2056J3QQ02 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm2056J3QQ02 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm2056J3QQ02 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm2056J3QQ02 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm2056J3QQ02 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm2056J3QQ02 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm2056J3QQ02 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm2056J3QQ02 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm2056J3QQ02 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm2056J3QQ02 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm2056J3QQ02 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm2056J3QQ02 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm2056J3QQ02 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm2056J3QQ02 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm2056J3QQ02 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm2056J3QQ02 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm2056J3QQ02 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm2056J3QQ02 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm2056J3QQ02 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm2056J3QQ02 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm2056J3QQ02 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm2056J3QQ02 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm2056J3QQ02 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm2056J3QQ02 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm2056J3QQ02 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm2056J3QQ02 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm2056J3QQ02 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm2056J3QQ02 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm2056J3QQ02 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm2056J3QQ02 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm2056J3QQ02 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm2056J3QQ02 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm2056J3QQ02 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm2056J3QQ02 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm2056J3QQ02 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm2056J3QQ02 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm2056J3QQ02 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm2056J3QQ02 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm2056J3QQ02 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm2056J3QQ02 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm2056J3QQ02 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm2056J3QQ02 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm2056J3QQ02 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm2056J3QQ02 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm2056J3QQ02 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm2056J3QQ02 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm2056J3QQ02 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm2056J3QQ02 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm2056J3QQ02 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm2056J3QQ02 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm2056J3QQ02 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm2056J3QQ02 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm2056J3QQ02 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm2056J3QQ02 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm2056J3QQ02 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm2056J3QQ02 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm2056J3QQ02 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm2056J3QQ02 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm2056J3QQ02 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm2056J3QQ02 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm2056J3QQ02 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm2056J3QQ02 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm2056J3QQ02 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm2056J3QQ02 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm2056J3QQ02 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm2056J3QQ02 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm2056J3QQ02 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm2056J3QQ02 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm2056J3QQ02 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm2056J3QQ02 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm2056J3QQ02 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms