Protein–RNA interactions for Protein: J3QPX0

5730507C01Rik, RIKEN cDNA 5730507C01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5730507C01RikJ3QPX0 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
5730507C01RikJ3QPX0 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
5730507C01RikJ3QPX0 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
5730507C01RikJ3QPX0 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
5730507C01RikJ3QPX0 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
5730507C01RikJ3QPX0 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
5730507C01RikJ3QPX0 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
5730507C01RikJ3QPX0 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
5730507C01RikJ3QPX0 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
5730507C01RikJ3QPX0 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
5730507C01RikJ3QPX0 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
5730507C01RikJ3QPX0 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
5730507C01RikJ3QPX0 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
5730507C01RikJ3QPX0 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
5730507C01RikJ3QPX0 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
5730507C01RikJ3QPX0 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
5730507C01RikJ3QPX0 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
5730507C01RikJ3QPX0 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
5730507C01RikJ3QPX0 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
5730507C01RikJ3QPX0 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
5730507C01RikJ3QPX0 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
5730507C01RikJ3QPX0 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
5730507C01RikJ3QPX0 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
5730507C01RikJ3QPX0 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
5730507C01RikJ3QPX0 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
5730507C01RikJ3QPX0 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
5730507C01RikJ3QPX0 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
5730507C01RikJ3QPX0 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
5730507C01RikJ3QPX0 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
5730507C01RikJ3QPX0 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
5730507C01RikJ3QPX0 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
5730507C01RikJ3QPX0 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
5730507C01RikJ3QPX0 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
5730507C01RikJ3QPX0 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
5730507C01RikJ3QPX0 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
5730507C01RikJ3QPX0 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
5730507C01RikJ3QPX0 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
5730507C01RikJ3QPX0 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
5730507C01RikJ3QPX0 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
5730507C01RikJ3QPX0 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
5730507C01RikJ3QPX0 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
5730507C01RikJ3QPX0 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
5730507C01RikJ3QPX0 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
5730507C01RikJ3QPX0 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
5730507C01RikJ3QPX0 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
5730507C01RikJ3QPX0 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
5730507C01RikJ3QPX0 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
5730507C01RikJ3QPX0 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
5730507C01RikJ3QPX0 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
5730507C01RikJ3QPX0 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
5730507C01RikJ3QPX0 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
5730507C01RikJ3QPX0 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
5730507C01RikJ3QPX0 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
5730507C01RikJ3QPX0 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
5730507C01RikJ3QPX0 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
5730507C01RikJ3QPX0 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
5730507C01RikJ3QPX0 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
5730507C01RikJ3QPX0 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
5730507C01RikJ3QPX0 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
5730507C01RikJ3QPX0 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
5730507C01RikJ3QPX0 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
5730507C01RikJ3QPX0 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
5730507C01RikJ3QPX0 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
5730507C01RikJ3QPX0 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
5730507C01RikJ3QPX0 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
5730507C01RikJ3QPX0 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
5730507C01RikJ3QPX0 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
5730507C01RikJ3QPX0 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
5730507C01RikJ3QPX0 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
5730507C01RikJ3QPX0 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
5730507C01RikJ3QPX0 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
5730507C01RikJ3QPX0 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
5730507C01RikJ3QPX0 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
5730507C01RikJ3QPX0 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
5730507C01RikJ3QPX0 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
5730507C01RikJ3QPX0 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
5730507C01RikJ3QPX0 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
5730507C01RikJ3QPX0 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
5730507C01RikJ3QPX0 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
5730507C01RikJ3QPX0 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
5730507C01RikJ3QPX0 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
5730507C01RikJ3QPX0 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
5730507C01RikJ3QPX0 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
5730507C01RikJ3QPX0 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
5730507C01RikJ3QPX0 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
5730507C01RikJ3QPX0 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
5730507C01RikJ3QPX0 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
5730507C01RikJ3QPX0 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
5730507C01RikJ3QPX0 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
5730507C01RikJ3QPX0 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
5730507C01RikJ3QPX0 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
5730507C01RikJ3QPX0 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
5730507C01RikJ3QPX0 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
5730507C01RikJ3QPX0 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
5730507C01RikJ3QPX0 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
5730507C01RikJ3QPX0 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
5730507C01RikJ3QPX0 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
5730507C01RikJ3QPX0 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
5730507C01RikJ3QPX0 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
5730507C01RikJ3QPX0 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms