Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm2035J3QP87 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm2035J3QP87 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm2035J3QP87 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm2035J3QP87 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm2035J3QP87 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm2035J3QP87 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm2035J3QP87 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm2035J3QP87 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm2035J3QP87 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm2035J3QP87 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm2035J3QP87 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm2035J3QP87 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm2035J3QP87 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm2035J3QP87 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm2035J3QP87 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm2035J3QP87 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm2035J3QP87 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm2035J3QP87 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm2035J3QP87 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm2035J3QP87 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm2035J3QP87 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm2035J3QP87 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm2035J3QP87 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm2035J3QP87 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm2035J3QP87 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm2035J3QP87 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm2035J3QP87 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm2035J3QP87 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm2035J3QP87 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm2035J3QP87 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm2035J3QP87 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm2035J3QP87 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm2035J3QP87 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm2035J3QP87 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm2035J3QP87 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm2035J3QP87 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm2035J3QP87 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm2035J3QP87 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm2035J3QP87 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm2035J3QP87 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm2035J3QP87 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm2035J3QP87 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm2035J3QP87 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm2035J3QP87 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm2035J3QP87 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm2035J3QP87 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm2035J3QP87 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm2035J3QP87 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm2035J3QP87 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm2035J3QP87 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm2035J3QP87 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm2035J3QP87 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm2035J3QP87 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm2035J3QP87 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm2035J3QP87 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm2035J3QP87 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm2035J3QP87 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm2035J3QP87 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm2035J3QP87 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm2035J3QP87 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm2035J3QP87 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm2035J3QP87 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm2035J3QP87 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm2035J3QP87 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm2035J3QP87 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm2035J3QP87 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm2035J3QP87 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm2035J3QP87 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm2035J3QP87 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm2035J3QP87 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm2035J3QP87 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm2035J3QP87 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm2035J3QP87 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gm2035J3QP87 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gm2035J3QP87 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm2035J3QP87 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm2035J3QP87 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm2035J3QP87 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm2035J3QP87 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm2035J3QP87 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm2035J3QP87 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm2035J3QP87 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm2035J3QP87 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm2035J3QP87 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm2035J3QP87 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm2035J3QP87 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm2035J3QP87 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm2035J3QP87 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm2035J3QP87 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm2035J3QP87 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm2035J3QP87 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm2035J3QP87 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm2035J3QP87 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm2035J3QP87 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm2035J3QP87 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm2035J3QP87 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm2035J3QP87 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm2035J3QP87 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm2035J3QP87 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
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