Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP9

Fam240a, Family with sequence similarity 240 member A, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam240aJ3QNP9 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Fam240aJ3QNP9 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Fam240aJ3QNP9 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Fam240aJ3QNP9 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Fam240aJ3QNP9 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Fam240aJ3QNP9 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Fam240aJ3QNP9 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Fam240aJ3QNP9 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Fam240aJ3QNP9 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Fam240aJ3QNP9 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Fam240aJ3QNP9 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Fam240aJ3QNP9 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Fam240aJ3QNP9 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Fam240aJ3QNP9 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Fam240aJ3QNP9 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Fam240aJ3QNP9 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Fam240aJ3QNP9 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Fam240aJ3QNP9 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Fam240aJ3QNP9 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Fam240aJ3QNP9 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Fam240aJ3QNP9 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Fam240aJ3QNP9 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Fam240aJ3QNP9 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Fam240aJ3QNP9 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Fam240aJ3QNP9 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Fam240aJ3QNP9 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Fam240aJ3QNP9 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Fam240aJ3QNP9 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Fam240aJ3QNP9 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Fam240aJ3QNP9 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Fam240aJ3QNP9 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Fam240aJ3QNP9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Fam240aJ3QNP9 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Fam240aJ3QNP9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Fam240aJ3QNP9 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Fam240aJ3QNP9 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Fam240aJ3QNP9 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Fam240aJ3QNP9 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fam240aJ3QNP9 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fam240aJ3QNP9 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fam240aJ3QNP9 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fam240aJ3QNP9 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fam240aJ3QNP9 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fam240aJ3QNP9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fam240aJ3QNP9 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fam240aJ3QNP9 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fam240aJ3QNP9 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fam240aJ3QNP9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fam240aJ3QNP9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fam240aJ3QNP9 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fam240aJ3QNP9 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fam240aJ3QNP9 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fam240aJ3QNP9 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fam240aJ3QNP9 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fam240aJ3QNP9 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fam240aJ3QNP9 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Fam240aJ3QNP9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fam240aJ3QNP9 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fam240aJ3QNP9 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fam240aJ3QNP9 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fam240aJ3QNP9 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fam240aJ3QNP9 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fam240aJ3QNP9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fam240aJ3QNP9 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fam240aJ3QNP9 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fam240aJ3QNP9 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fam240aJ3QNP9 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fam240aJ3QNP9 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fam240aJ3QNP9 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fam240aJ3QNP9 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fam240aJ3QNP9 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fam240aJ3QNP9 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fam240aJ3QNP9 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fam240aJ3QNP9 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fam240aJ3QNP9 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fam240aJ3QNP9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fam240aJ3QNP9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fam240aJ3QNP9 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fam240aJ3QNP9 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fam240aJ3QNP9 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fam240aJ3QNP9 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fam240aJ3QNP9 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fam240aJ3QNP9 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fam240aJ3QNP9 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fam240aJ3QNP9 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fam240aJ3QNP9 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fam240aJ3QNP9 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fam240aJ3QNP9 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fam240aJ3QNP9 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fam240aJ3QNP9 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fam240aJ3QNP9 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fam240aJ3QNP9 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fam240aJ3QNP9 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fam240aJ3QNP9 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fam240aJ3QNP9 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fam240aJ3QNP9 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fam240aJ3QNP9 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fam240aJ3QNP9 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fam240aJ3QNP9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fam240aJ3QNP9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms