Protein–RNA interactions for Protein: J3QN38

Gm21972, Predicted gene 21972 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21972J3QN38 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm21972J3QN38 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm21972J3QN38 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm21972J3QN38 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm21972J3QN38 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm21972J3QN38 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm21972J3QN38 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm21972J3QN38 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm21972J3QN38 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm21972J3QN38 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm21972J3QN38 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm21972J3QN38 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm21972J3QN38 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm21972J3QN38 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm21972J3QN38 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm21972J3QN38 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm21972J3QN38 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm21972J3QN38 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm21972J3QN38 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm21972J3QN38 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm21972J3QN38 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm21972J3QN38 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm21972J3QN38 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm21972J3QN38 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm21972J3QN38 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm21972J3QN38 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm21972J3QN38 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm21972J3QN38 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm21972J3QN38 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm21972J3QN38 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm21972J3QN38 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm21972J3QN38 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm21972J3QN38 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm21972J3QN38 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm21972J3QN38 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm21972J3QN38 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm21972J3QN38 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm21972J3QN38 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm21972J3QN38 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm21972J3QN38 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm21972J3QN38 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm21972J3QN38 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm21972J3QN38 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm21972J3QN38 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm21972J3QN38 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm21972J3QN38 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm21972J3QN38 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm21972J3QN38 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm21972J3QN38 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm21972J3QN38 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm21972J3QN38 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm21972J3QN38 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm21972J3QN38 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm21972J3QN38 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm21972J3QN38 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21972J3QN38 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21972J3QN38 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21972J3QN38 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21972J3QN38 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21972J3QN38 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21972J3QN38 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21972J3QN38 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21972J3QN38 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21972J3QN38 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21972J3QN38 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21972J3QN38 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21972J3QN38 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21972J3QN38 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21972J3QN38 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm21972J3QN38 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm21972J3QN38 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm21972J3QN38 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm21972J3QN38 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm21972J3QN38 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm21972J3QN38 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm21972J3QN38 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm21972J3QN38 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm21972J3QN38 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm21972J3QN38 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm21972J3QN38 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm21972J3QN38 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm21972J3QN38 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21972J3QN38 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21972J3QN38 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21972J3QN38 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21972J3QN38 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21972J3QN38 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21972J3QN38 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21972J3QN38 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21972J3QN38 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21972J3QN38 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21972J3QN38 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21972J3QN38 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21972J3QN38 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21972J3QN38 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21972J3QN38 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21972J3QN38 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21972J3QN38 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21972J3QN38 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm21972J3QN38 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms