Protein–RNA interactions for Protein: J3QME2

Gm20914, Predicted gene, 20914, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20914J3QME2 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20914J3QME2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20914J3QME2 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20914J3QME2 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20914J3QME2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20914J3QME2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20914J3QME2 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20914J3QME2 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20914J3QME2 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20914J3QME2 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20914J3QME2 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20914J3QME2 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20914J3QME2 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20914J3QME2 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20914J3QME2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20914J3QME2 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20914J3QME2 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20914J3QME2 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20914J3QME2 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20914J3QME2 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20914J3QME2 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20914J3QME2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20914J3QME2 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20914J3QME2 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20914J3QME2 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20914J3QME2 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20914J3QME2 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20914J3QME2 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20914J3QME2 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20914J3QME2 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20914J3QME2 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20914J3QME2 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20914J3QME2 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20914J3QME2 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20914J3QME2 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20914J3QME2 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20914J3QME2 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20914J3QME2 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20914J3QME2 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20914J3QME2 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20914J3QME2 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20914J3QME2 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20914J3QME2 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20914J3QME2 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20914J3QME2 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20914J3QME2 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20914J3QME2 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20914J3QME2 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20914J3QME2 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm20914J3QME2 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm20914J3QME2 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm20914J3QME2 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm20914J3QME2 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm20914J3QME2 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm20914J3QME2 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm20914J3QME2 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm20914J3QME2 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm20914J3QME2 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm20914J3QME2 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm20914J3QME2 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm20914J3QME2 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm20914J3QME2 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm20914J3QME2 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm20914J3QME2 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm20914J3QME2 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm20914J3QME2 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm20914J3QME2 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm20914J3QME2 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm20914J3QME2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm20914J3QME2 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm20914J3QME2 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm20914J3QME2 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm20914J3QME2 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20914J3QME2 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20914J3QME2 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20914J3QME2 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20914J3QME2 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20914J3QME2 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20914J3QME2 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20914J3QME2 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20914J3QME2 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20914J3QME2 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20914J3QME2 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20914J3QME2 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gm20914J3QME2 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20914J3QME2 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20914J3QME2 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20914J3QME2 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20914J3QME2 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20914J3QME2 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20914J3QME2 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20914J3QME2 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm20914J3QME2 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm20914J3QME2 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm20914J3QME2 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm20914J3QME2 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm20914J3QME2 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm20914J3QME2 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm20914J3QME2 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm20914J3QME2 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms