Protein–RNA interactions for Protein: J3QM43

Gm6594, Predicted pseudogene 6594, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6594J3QM43 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm6594J3QM43 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm6594J3QM43 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm6594J3QM43 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm6594J3QM43 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm6594J3QM43 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm6594J3QM43 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm6594J3QM43 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm6594J3QM43 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm6594J3QM43 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm6594J3QM43 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm6594J3QM43 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm6594J3QM43 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm6594J3QM43 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6594J3QM43 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6594J3QM43 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6594J3QM43 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6594J3QM43 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6594J3QM43 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6594J3QM43 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6594J3QM43 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6594J3QM43 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6594J3QM43 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6594J3QM43 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6594J3QM43 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6594J3QM43 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6594J3QM43 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6594J3QM43 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6594J3QM43 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6594J3QM43 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6594J3QM43 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6594J3QM43 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6594J3QM43 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6594J3QM43 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6594J3QM43 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6594J3QM43 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6594J3QM43 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6594J3QM43 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6594J3QM43 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6594J3QM43 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6594J3QM43 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6594J3QM43 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6594J3QM43 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6594J3QM43 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6594J3QM43 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6594J3QM43 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6594J3QM43 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6594J3QM43 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm6594J3QM43 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm6594J3QM43 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm6594J3QM43 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Gm6594J3QM43 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm6594J3QM43 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Gm6594J3QM43 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm6594J3QM43 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm6594J3QM43 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm6594J3QM43 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm6594J3QM43 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm6594J3QM43 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm6594J3QM43 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Gm6594J3QM43 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Gm6594J3QM43 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm6594J3QM43 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm6594J3QM43 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Gm6594J3QM43 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Gm6594J3QM43 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm6594J3QM43 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Gm6594J3QM43 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm6594J3QM43 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm6594J3QM43 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm6594J3QM43 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm6594J3QM43 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm6594J3QM43 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm6594J3QM43 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm6594J3QM43 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm6594J3QM43 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm6594J3QM43 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm6594J3QM43 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm6594J3QM43 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Gm6594J3QM43 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm6594J3QM43 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm6594J3QM43 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm6594J3QM43 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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