Protein–RNA interactions for Protein: J3KMP5

Gm21897, Predicted gene, 21897, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21897J3KMP5 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm21897J3KMP5 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm21897J3KMP5 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm21897J3KMP5 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm21897J3KMP5 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm21897J3KMP5 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm21897J3KMP5 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm21897J3KMP5 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm21897J3KMP5 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm21897J3KMP5 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm21897J3KMP5 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm21897J3KMP5 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm21897J3KMP5 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm21897J3KMP5 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm21897J3KMP5 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm21897J3KMP5 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm21897J3KMP5 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm21897J3KMP5 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm21897J3KMP5 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm21897J3KMP5 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm21897J3KMP5 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm21897J3KMP5 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm21897J3KMP5 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm21897J3KMP5 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm21897J3KMP5 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm21897J3KMP5 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm21897J3KMP5 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm21897J3KMP5 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm21897J3KMP5 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm21897J3KMP5 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm21897J3KMP5 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm21897J3KMP5 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm21897J3KMP5 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm21897J3KMP5 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm21897J3KMP5 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm21897J3KMP5 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm21897J3KMP5 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm21897J3KMP5 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm21897J3KMP5 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm21897J3KMP5 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm21897J3KMP5 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm21897J3KMP5 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm21897J3KMP5 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm21897J3KMP5 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm21897J3KMP5 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm21897J3KMP5 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm21897J3KMP5 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm21897J3KMP5 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm21897J3KMP5 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm21897J3KMP5 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm21897J3KMP5 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm21897J3KMP5 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm21897J3KMP5 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm21897J3KMP5 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm21897J3KMP5 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm21897J3KMP5 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm21897J3KMP5 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm21897J3KMP5 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm21897J3KMP5 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm21897J3KMP5 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm21897J3KMP5 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm21897J3KMP5 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm21897J3KMP5 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm21897J3KMP5 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm21897J3KMP5 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm21897J3KMP5 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm21897J3KMP5 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm21897J3KMP5 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm21897J3KMP5 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm21897J3KMP5 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm21897J3KMP5 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm21897J3KMP5 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm21897J3KMP5 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm21897J3KMP5 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm21897J3KMP5 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm21897J3KMP5 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm21897J3KMP5 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm21897J3KMP5 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm21897J3KMP5 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm21897J3KMP5 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm21897J3KMP5 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm21897J3KMP5 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm21897J3KMP5 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm21897J3KMP5 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm21897J3KMP5 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm21897J3KMP5 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm21897J3KMP5 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm21897J3KMP5 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm21897J3KMP5 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm21897J3KMP5 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm21897J3KMP5 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm21897J3KMP5 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm21897J3KMP5 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm21897J3KMP5 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm21897J3KMP5 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm21897J3KMP5 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm21897J3KMP5 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm21897J3KMP5 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm21897J3KMP5 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm21897J3KMP5 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77 ms