Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20830J3KML6 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20830J3KML6 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20830J3KML6 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20830J3KML6 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20830J3KML6 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20830J3KML6 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20830J3KML6 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20830J3KML6 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20830J3KML6 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20830J3KML6 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20830J3KML6 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20830J3KML6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20830J3KML6 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20830J3KML6 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20830J3KML6 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20830J3KML6 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20830J3KML6 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20830J3KML6 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20830J3KML6 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20830J3KML6 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20830J3KML6 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm20830J3KML6 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20830J3KML6 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20830J3KML6 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20830J3KML6 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20830J3KML6 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20830J3KML6 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20830J3KML6 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20830J3KML6 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20830J3KML6 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20830J3KML6 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20830J3KML6 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20830J3KML6 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20830J3KML6 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20830J3KML6 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20830J3KML6 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20830J3KML6 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20830J3KML6 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20830J3KML6 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20830J3KML6 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20830J3KML6 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20830J3KML6 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20830J3KML6 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20830J3KML6 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20830J3KML6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20830J3KML6 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20830J3KML6 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20830J3KML6 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20830J3KML6 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20830J3KML6 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20830J3KML6 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20830J3KML6 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20830J3KML6 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20830J3KML6 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20830J3KML6 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20830J3KML6 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20830J3KML6 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20830J3KML6 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20830J3KML6 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20830J3KML6 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20830J3KML6 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20830J3KML6 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20830J3KML6 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20830J3KML6 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20830J3KML6 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20830J3KML6 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20830J3KML6 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20830J3KML6 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20830J3KML6 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20830J3KML6 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20830J3KML6 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20830J3KML6 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20830J3KML6 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20830J3KML6 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20830J3KML6 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20830J3KML6 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20830J3KML6 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20830J3KML6 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20830J3KML6 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20830J3KML6 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20830J3KML6 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20830J3KML6 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20830J3KML6 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20830J3KML6 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20830J3KML6 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20830J3KML6 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20830J3KML6 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20830J3KML6 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20830J3KML6 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20830J3KML6 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20830J3KML6 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20830J3KML6 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20830J3KML6 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20830J3KML6 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20830J3KML6 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20830J3KML6 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20830J3KML6 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20830J3KML6 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20830J3KML6 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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