Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI0

Gm20815, Predicted gene, 20815, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20815J3KMI0 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20815J3KMI0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20815J3KMI0 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20815J3KMI0 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20815J3KMI0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20815J3KMI0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20815J3KMI0 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20815J3KMI0 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20815J3KMI0 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20815J3KMI0 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20815J3KMI0 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20815J3KMI0 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20815J3KMI0 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20815J3KMI0 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20815J3KMI0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20815J3KMI0 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20815J3KMI0 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20815J3KMI0 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20815J3KMI0 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20815J3KMI0 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20815J3KMI0 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20815J3KMI0 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20815J3KMI0 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20815J3KMI0 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20815J3KMI0 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20815J3KMI0 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20815J3KMI0 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20815J3KMI0 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20815J3KMI0 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20815J3KMI0 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20815J3KMI0 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20815J3KMI0 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20815J3KMI0 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20815J3KMI0 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20815J3KMI0 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20815J3KMI0 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20815J3KMI0 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20815J3KMI0 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20815J3KMI0 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20815J3KMI0 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20815J3KMI0 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20815J3KMI0 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20815J3KMI0 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20815J3KMI0 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20815J3KMI0 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20815J3KMI0 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20815J3KMI0 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20815J3KMI0 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20815J3KMI0 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm20815J3KMI0 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm20815J3KMI0 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm20815J3KMI0 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm20815J3KMI0 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm20815J3KMI0 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm20815J3KMI0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm20815J3KMI0 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm20815J3KMI0 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm20815J3KMI0 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm20815J3KMI0 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm20815J3KMI0 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Gm20815J3KMI0 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm20815J3KMI0 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm20815J3KMI0 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm20815J3KMI0 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Gm20815J3KMI0 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm20815J3KMI0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm20815J3KMI0 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm20815J3KMI0 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm20815J3KMI0 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm20815J3KMI0 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20815J3KMI0 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20815J3KMI0 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20815J3KMI0 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20815J3KMI0 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20815J3KMI0 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20815J3KMI0 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20815J3KMI0 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20815J3KMI0 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20815J3KMI0 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20815J3KMI0 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20815J3KMI0 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gm20815J3KMI0 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20815J3KMI0 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20815J3KMI0 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20815J3KMI0 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20815J3KMI0 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20815J3KMI0 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20815J3KMI0 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20815J3KMI0 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm20815J3KMI0 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm20815J3KMI0 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm20815J3KMI0 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm20815J3KMI0 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm20815J3KMI0 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm20815J3KMI0 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm20815J3KMI0 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm20815J3KMI0 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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