Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Taf4bG5E8Z2 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Taf4bG5E8Z2 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Taf4bG5E8Z2 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Taf4bG5E8Z2 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Taf4bG5E8Z2 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Taf4bG5E8Z2 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Taf4bG5E8Z2 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Taf4bG5E8Z2 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Taf4bG5E8Z2 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Taf4bG5E8Z2 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Taf4bG5E8Z2 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Taf4bG5E8Z2 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Taf4bG5E8Z2 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Taf4bG5E8Z2 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Taf4bG5E8Z2 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Taf4bG5E8Z2 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Taf4bG5E8Z2 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Taf4bG5E8Z2 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Taf4bG5E8Z2 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Taf4bG5E8Z2 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Taf4bG5E8Z2 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Taf4bG5E8Z2 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Taf4bG5E8Z2 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Taf4bG5E8Z2 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Taf4bG5E8Z2 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Taf4bG5E8Z2 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Taf4bG5E8Z2 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Taf4bG5E8Z2 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Taf4bG5E8Z2 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Taf4bG5E8Z2 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Taf4bG5E8Z2 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Taf4bG5E8Z2 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Taf4bG5E8Z2 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Taf4bG5E8Z2 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Taf4bG5E8Z2 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Taf4bG5E8Z2 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Taf4bG5E8Z2 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Taf4bG5E8Z2 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Taf4bG5E8Z2 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Taf4bG5E8Z2 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Taf4bG5E8Z2 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Taf4bG5E8Z2 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Taf4bG5E8Z2 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Taf4bG5E8Z2 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Taf4bG5E8Z2 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Taf4bG5E8Z2 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Taf4bG5E8Z2 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Taf4bG5E8Z2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Taf4bG5E8Z2 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Taf4bG5E8Z2 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Taf4bG5E8Z2 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Taf4bG5E8Z2 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Taf4bG5E8Z2 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Taf4bG5E8Z2 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Taf4bG5E8Z2 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Taf4bG5E8Z2 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Taf4bG5E8Z2 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Taf4bG5E8Z2 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Taf4bG5E8Z2 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Taf4bG5E8Z2 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Taf4bG5E8Z2 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Taf4bG5E8Z2 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Taf4bG5E8Z2 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Taf4bG5E8Z2 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Taf4bG5E8Z2 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Taf4bG5E8Z2 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Taf4bG5E8Z2 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Taf4bG5E8Z2 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Taf4bG5E8Z2 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Taf4bG5E8Z2 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Taf4bG5E8Z2 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Taf4bG5E8Z2 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Taf4bG5E8Z2 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Taf4bG5E8Z2 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Taf4bG5E8Z2 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Taf4bG5E8Z2 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Taf4bG5E8Z2 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Taf4bG5E8Z2 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Taf4bG5E8Z2 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Taf4bG5E8Z2 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Taf4bG5E8Z2 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Taf4bG5E8Z2 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Taf4bG5E8Z2 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Taf4bG5E8Z2 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Taf4bG5E8Z2 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Taf4bG5E8Z2 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Taf4bG5E8Z2 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Taf4bG5E8Z2 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Taf4bG5E8Z2 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Taf4bG5E8Z2 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Taf4bG5E8Z2 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Taf4bG5E8Z2 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Taf4bG5E8Z2 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Taf4bG5E8Z2 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Taf4bG5E8Z2 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Taf4bG5E8Z2 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Taf4bG5E8Z2 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Taf4bG5E8Z2 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Taf4bG5E8Z2 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
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